卫生部门和卫生健康委员会的区别在于部门不同，主要职责不同:
1.不同部门，卫生厅是根据党中央、国务院批准设立的，是省人民政府主管全省卫生工作的组成部门。国家卫生健康委员会是国务院的组成部门，正部级。
2，主要职责不同，卫生部门推进医药卫生体制改革。贯彻党和国家关于卫生工作的法律、法规和方针、政策，组织实施国家卫生标准和技术规范。卫生委员会，组织制定国家卫生政策，起草卫生与健康事业发展的法律法规、政策和规划，制定部门规章和标准并组织实施。
人民健康是国家富强、民族昌盛的重要标志。为推进健康中国战略实施，树立“大健康、大健康”理念，变治病为民健，防控重大疾病，积极应对人口老龄化，加快老龄事业和产业发展，为人民群众提供全方位、全周期健康服务。
