两者的区别在于，医保局和社保局是一个单位，现在都隶属于地方人力资源和社会保障局。
医保局负责受理基本医疗保险、工伤保险、生育保险和离休干部医疗费用统筹基金的审批、支付、管理等日常事务，为参加基本医疗保险、工伤保险和生育保险的用人单位、职工和离休干部提供相应的管理服务。
社保局是人力资源和社会保障局下属的行政机构，负责全市社会保险基金的征缴和管理。
