民办本科和公办本科的区别表现在以下几个方面:
首先，办学主体资质不同。公立本科是国家财政投资，下属事业单位，或者省属事业单位，或者市属事业单位。中国的高校中，有教育部直属高校，也有工信部直属高校。有国家地震局直属高校，国务院侨办，国家民委，公安部，应急管理部，司法部。民办高校或独立学院由社会组织出资或由教育培训机构、社会力量、社会组织与公办本科高校联合办学。
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公立大学和私立大学有很大的不同。
其次，办学经费不同。有了国有大学国家财政的强大后盾和支持，无论是师资还是人才引进方面。国家重点实验室、重点学科、博士后科研流动站、博士和硕士学位点建设势头强劲，管理体制也比较丰富。所以在金融投资上有先天优势。
独立学院和民办大学是由个人或社会团体资助的，经费相对较弱，所以会在一定程度上制约学校的发展。
第三个方面，创新能力不同。一般国有大学引进的都是一流的大师，一流的人才，或者在某一领域有重大成就的领军人才，或者杰出人才。在院系里，一般都有一些两院院士。还是973首席科学家作为教师的有力支持。它还得到了国家重点实验室、国家工程技术中心和国家重点学科的大力支持。很多项目都有国家强大的配套资金，所以创新动能充足，创新成果丰富。因此，培养具有国际视野、创新意识和创新能力的优秀人才是可能的。
而民办大学或独立学院在博士点、博士后科研流动站、国家重点建设学科，或国家重点实验室、国家工程技术研究中心等领域都很差很弱，根本无法与公办本科大学相比。
第四，招生质量不同。公立大学一般有一本书。第二批招生录取，招生生源质量优良。部分地区本科二批和本科三批的招生批次已经合并。但是家长和考生在填报高考志愿的时候，比较好的考生是首选国家的公立本科大学。独立学院和民办高校的招生质量明显低于公办本科高校。
第五，培养人才的目标不同。很多公立大学是学术型大学、教学研究型大学，很多双一流建设大学或一流学科入选大学。当然也有很多应用型大学。很多高校培养的是学术型人才和研究型人才，而民办高校和独立学院没有一所是教学研究型大学，没有一所进入双一流建设大学的行列。都是培养应用型人才。
总之，国有大学和私立大学都在中国的高等教育体系中。教育形式和办学性质不同，虽然两种办学机制并存，两所高校的毕业生在人才招聘、正式注册、研究生招生等方面享受相同的政策，但两者之间还是有很大的差异。
