洞穴中的动物主要有无脊椎动物、两栖动物、鱼和蛇。洞穴是一种特殊的生态环境。由于洞穴相对封闭,生活在洞穴中的生物进化速度比外界慢,变化不明显。
由于缺少光照和营养,食物非常匮乏,所以生活在洞穴中的生物数量一般较少,活动范围通常局限在一定的区域内。
由于长年不见阳光,生活在洞穴中的动物视力普遍较差,甚至有些动物的眼睛已经完全退化,比如著名的盲鱼。