南瓜子的正确吃法是晒干后再吃，或者用盐水煮熟后烤干。总的来说，南瓜子怎么吃没有太大的讲究。同时，南瓜子最常见的吃法是作为休闲零食来吃。但是，南瓜子不宜多吃。每天只能吃50g左右的南瓜子。
干燥成熟的南瓜籽扁圆形、卵圆形，末端稍尖，外观黄白色，边缘稍有棱纹，长约1.2 ~ 2cm，宽约0.7 ~ 1.2cm。
南瓜子表面有毛状皮毛，边缘多，种皮厚。肚脐位于尖端。剥去种皮，可以看到一层薄薄的绿色胚乳，有两片黄色的厚子叶。
