主要有以下几点：
保护作用：抗逆作用，抵御噬菌体的侵染，抵御宿主免疫系统等；
贮藏养料；
作为透性屏障和离子交换系统；
表面附着作用；
信息识别；
堆积代谢废物
荚膜(capsule)荚膜:某些细菌表面的特殊结构，是位于细胞壁表面的一层松散的粘液物质，荚膜的成分因不同菌种而异，主要是由葡萄糖与葡萄糖醛酸组成的聚合物，也有含多肽与脂质的。抗吞噬作用、黏附作用、抗有害物质的损伤作用、抗干燥作用、当缺乏营养时，荚膜可被利用作碳源和能源。细菌是在自然界分布最广、个体数量最多的有机体，是大自然物质循环的主要参与者。细菌主要由细胞壁、细胞膜、细胞质、核质体等部分构成，有的细菌还有荚膜、鞭毛、菌毛、伞毛等特殊结构。多糖\多肽\其他物质多糖：多数细菌的荚膜由多糖组成。多糖的分子组成和构型多样，令其结构极为复杂，成为血清学分型的基础。例如肺炎双球菌，根据其荚膜多糖的抗原性，至少可将其分成85个血清型。多肽：少数细菌荚膜为多肽，如炭疽芽胞杆菌、鼠疫杆菌等。许多细菌的最外表还覆盖着一层多糖类物质，边界明显的称为荚膜（capsule），如肺炎球菌，边界不明显的称为黏液层（slime layer），如葡萄球菌。荚膜对细菌的生存具有重要意义，细菌不仅可利用荚膜抵御不良环境；保护自身不受白细胞吞噬；而且能有选择地黏附到特定细胞的表面上，表现出对靶细胞的专一攻击能力。例如，伤寒沙门杆菌能专一性地侵犯肠道淋巴组织。细菌荚膜的纤丝还能把细菌分泌的消化酶贮存起来，以备攻击靶细胞之用。
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