首先，光纤差动保护的原理和一般的纵联差动保护原理基本上是一样的，都是保护装置通过计算三相电流的变化，判断三相电流的向量和是否为零来确定是否动作，当接在电流互感器的二次侧的电流继电器（包括零序电流）中有电流流过达到保护动作整定值是，保护就动作，跳开故障线路的开关。即使是微机保护装置，其原理也是这样的。
但是，光纤差动保护采用分相电流差动元件作为快速主保护，并采用PCM光纤或光缆作为通道，使其动作速度更快，因而是短线路的主保护！另外，光纤差动保护和其它差动保护的不同之处，还在于所采用的通道形式不同。纵联保护的通道一般有以下几种类型：
1电力线载波纵联保护，也就是常说的高频保护，利用电力输电线路作为通道传输高频信号；
2微波纵联保护，简称微波保护，利用无线通道，需要天线无线传输；
3光纤纵联保护，简称光纤保护，利用光纤光缆作为通道；
4导引线纵联保护，简称导引线保护，利用导引线直接比较线路两端电流的幅值和相位，以判别区内、区外故障。
新投运或大修后的线路或母线，本身存在一定的电容以及对地电容，在合上母联断路器或一侧断路器后，会产生冲击电流，倘若此时投入纵联差动保护，则合上的断路器里有电流流入线路或母线，而本该流出电流的断路器确因分闸而无电流，有可能造成差动保护误动，致使充电失败。
也正是这个原因，在充电试验时，将纵联差动保护退出。
电动机纵联差动保护不会因为电源与电动机间的距离较远而产生不平衡电流！
但是由于两侧电流互感器的特性不可能完全一致，所以同样会产生不平衡电流，这部分差流是一定要在定值计算时考虑进去的。由于差动保护装置是具有比率制动特性的，只要差动保护定值计算合理这样的差流是不会引起装置误动作的！
两者的特点如下：
横差保护属于发电机匝间短路保护，大容量发电机一般都由两个并联的绕组组成，正常时两绕组的电势相等，各供出一半的负荷电流，任一绕组匝间短路，两绕组电势不再相等，出现电势差在两绕组中产生环流。
纵差保护是发电机内部相间短路的主保护，中性点侧和发电机引出线侧分别装有两组电流互感器，其保护范围是定子绕组及其引出线。
扩展资料：
横差动保护保护原理：
对定子绕组具有两个并联支路的发电机，宜装设一个单继电器式横联差动保护，为
消除发电机电势波形畸变所产生的高次谐波的影响，中性点电流互感器的输出经过高次
谐波滤波器。对具有三个或以上并联支路的发电机，可在各支路中性点连接后的中性点
连线上装设一个或多个横差继电器。
发电机横联差动保护用于保护发电机的匝间短路。单继电器式横联差动保护原理接线如图1。电流互感器1装于发电机两个并联星形绕组中性点的联接线上。
由于只用一只电流互感器，不存在电流互感器误差引起的不平衡电流。三次谐波过滤器2用来滤掉三次谐波造成的不平衡电流。保护装置的动作电流Idz=（02～03）Ief。
参考资料：
纵联差动保护_百度百科
横联差动保护_百度百科
所谓输电线的纵联保护，就是用某种通信通道将输电线两端的保护装置纵向联结起来，将各端的电气量（电流、功率的方向等）传送到对端，将两端的电气量比较，以判断故障在本线路范围内还是在线路范围外，从而决定是否切断被保护线路。因此，理论上这种纵联保护具有绝对的选择性。
差动保护是一种依据被保护电气设备进出线两端电流差值的变化构成的对电气设备的保护装置，一般分为纵联差动保护和横联差动保护。变压器的差动保护属纵联差动保护，横联差动保护则常用于变电所母线等设备的保护。
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