方法有多种，如下：
1、根据物质的分类判断 ①离子晶体---金属氧化物（如K2O、Na2O2等）、强碱（如NaOH、KOH等）和绝大多数的盐类是离子晶体 ②分子晶体---卤素、氧气、氢气等大多数非金属单质（除金刚石、石墨、晶体硅、晶体硼外）、稀有气体、所有非金属氢化物、多数非金属氧化物（除SiO2外）、含氧酸（几乎所有的酸）、绝大多数有机物的晶体都是分子晶体 ③原子晶体常见的---某些非金属单质:金刚石、晶体硅（Si） 、晶体硼（B）,某些非金属化合物：二氧化硅（SiO2 ） 、碳化硅（SiC ）、 Si3N4、BN、 AlN、（ Al2O3 ）等 ④金属晶体---金属单质（除汞外）与合金
2、依据组成晶体的微粒及微粒间的作用判断 （1）离子晶体的微粒是阴、阳离子，微粒间的作用是离子键； （2）分子晶体的微粒是分子，微粒间的作用为分子间作用力； （3）原子晶体的微粒是原子，微粒间的作用是共价键； （4）金属晶体的微粒是金属阳离子和自由电子，微粒间的作用是金属键。
3 依据晶体的熔点判断 （1）离子晶体的熔点较高，常在数百度至一千余度； （2）分子晶体熔点低，常在数百度以下至很低温度； （3）原子晶体熔点高，常在一千度至几千度； （4）金属晶体熔点高低皆有。
4 依据导电性判断 （1）离子晶体水溶液及熔化时能导电； （2）分子晶体为非导体，而分子晶体中的电解质（如酸和部分非金属气态氢化物）溶于水，使分子内的化学键断裂形成自由离子也能导电； （3）原子晶体一般为非导体，但有些能导电，如晶体硅（半导体）； （4）金属晶体是电的良导体。
5 依据硬度和机械性能判断 （1）离子晶体硬度较大或略硬而脆； （2）分子晶体硬度小且较脆； （3）原子晶体硬度大； （4）金属晶体多数硬度大，但也有较低的，且具有延展性。 石墨可以看成混合型晶体或过渡晶体。因为石墨中C原子间为共价键连接而层与层间为分子间作用力连接 。
建议：一般以物质分类最实用，把几种方法综合使用。
分子晶体和原子晶体的区别以及区分方法：
原子晶体：相邻原子之间通过强烈的共价键结合而成的空间网状结构的晶体叫做原子晶体。
分子晶体：分子间通过分子间作用力(包括范德华力和氢键)构成的晶体。
原子晶体的构型是：原子----共价键----原子。
分子晶体的构型是：（原子----共价键----原子）---分子间作用力----（原子----共价键----原子）。两个括号中为分子，也就是说原子晶体是原子直接由共价键相连组成的晶体。分子晶体是原子先通过共价键组成分子，分子再通过分子间作用力（包括范德华力和氢键）组成晶体。
常见原子晶体有：金刚石、硅、碳化硅、氮化硅、氮化硼等。
常见分子晶体有：全部有机物（不包括有机物形成的盐）、双原子单质、双原子气体、无机酸等。
共价晶体和分子晶体区别是后者一般是通过分子间范德华力作用形成，而前者一般通过原子共价键作用形成。共价化合物是指构成化合物的原子之间仅以共价键相连接，原子晶体和分子晶体是物质结晶的形式，共价化合物可能以原子晶体形式存在，也可以以分子晶体形式存在，例如SiC，是大量的Si原子和C原子以共价键连接形成巨大的空间立体网状结构，而干冰，是CO2分子以分子间作用力结合形成的分子晶体。
共价晶体和分子晶体的定义
共价晶体主要由共价键结合形成的晶体，常见的金刚石，硅，氮化硅，氧化硅等都是共价晶体。共价晶体不是原子晶体，原子晶体晶格能远比共价晶体大，所以更加稳定，原子晶体整个就是一个分子，共价晶体是无数个分子依靠氢键范德华力结合，原子晶体大多透明，分子晶体大多不透明。
分子间通过分子间作用力，分子间作用力又名范德华力，而氢键不是化学键，是一种特殊的分子间作用力，属于分子间作用力构成的晶体，构成微粒，分子。
微粒间作用，分子间作用力，部分晶体中存在氢键，分子间作用力的大小决定了晶体的物理性质，分子的相对分子质量越大，分子间作用力越大，晶体熔沸点越高，硬度越大，分子内存在化学键，在晶体状态改变时不被破坏，分子间内部微粒采用紧密堆积方式排列。
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