1、机构性质不相同
事业单位一般是国家设置的带有一定的公益性质的机构，但不属于政府机构，与公务员是不同的。一般情况下国家会对这些事业单位予以财政补助。
分为全额拨款事业单位，如学校等，差额拨款事业单位，如医院等，还有一种是自主事业单位，是国家不拨款的事业单位。
2、身份不相同
进入行政编制的意味着你是国家公务员，如通过了选调生考试就是国家公务员。国家公务员享受着国家的各种法定待遇，如医疗、晋级等。
事业编制是事业单位编制的总称，像学校就是典型的事业单位。事业编制不一定要求是公务员，而进入行政编制的要求是必须要通过国家公务员考试。
3、级别不相同
在行政编制就是国家公务员，是有级别的。如你第一年是科员，可能是最低一级的，你几年以后当了科长，就是股级。再几年以后当了局长，就是局级。
你如果是行政编制，那你就是“走”级别的。而事业编制，名义上是国家干部，实际上还是工人身份，“走“的是职称，比如你几年以后是初级工，几年以后是中级工，几年以后是高级工。
4、退休后待遇不相同
公务员不用交养老金，所以退休后差别还是比较大的，如果是你是事业单位的，那你每个月发的工资中，会扣除养老金。而公务员不用扣。在部队同样级别，工资待遇基本相同。转业以后，因编制不同，待遇可能就会相差很大了。
行政编和事业编的区别：工资方面的区别，事业编制是由地方财政发放工资，行政编制是由中央财政发放工资；晋升方式的不同，公务员晋升包括领导职务晋升和职级晋升，事业编人员是不能直接提拔晋升的；公务员车补已经全部发放到位了，而事业单位现在大部分还是实报实销，公务员可以享受通讯补贴，事业编没有通讯补贴。
晋升方式不同，是行政编与事业编最大的区别，这是由公务员和事业编人员的身份决定的。行政编绝大部分都是公务员，公务员晋升包括领导职务晋升和职级晋升。领导职务晋升就是大家熟知的副科级领导、正科级领导、副处级领导、正处级领导等，像乡镇长、局长、县长、市长、厅长等职务，都属于公务员领导职务，晋升这些职务必须是公务员，事业编人员是不能直接提拔晋升的。
在公车改革和计发年终绩效考核奖金之前，公务员和事业单位本来是基本没有区别的，每个月发的工资也差不多，年底发的取暖费、精神文明奖等也都是一样的。但由于公务用车改革后，由于政策的不同，造成了车补的不同。现在公务员车补已经全部发放到位了，科员每一个月可以拿到400左右的补贴，而事业单位现在大部分还是实报实销，并且，有的地方连通讯补贴都有区别，公务员可以享受通讯补贴，事业编没有通讯补贴。除此之外，就是年终绩效考核奖，这一项至少在一万元左右吧。
行政编制和事业编制的区别如下。
1、内涵不同
行政单位是国家机关，而事业单位是实施政府某项公益服务的部门，是社会服务组织。
2、担负的职责不同
行政单位是负责对国家各项行政事务进行组织、管理和指挥；而事业单位是为了社会的公益目的从事教育、文化、卫生、科技等活动。
3、编制和工资待遇的来源不同
行政单位使用行政编制、由国家行政经费负担。事业单位使用事业编制，由国家事业经费负担。事业单位由全额拨款的，有部分拨款的，还有事业单位企业化管理的。行政单位人员的工资按《公务员法》由国家负担，而事业单位则根据不同的管理模式实行不同的待遇。
行政单位或事业单位根据根据工作性质，也有具有行政事业编制的非公务员的人就职，一般是从事后勤保障的工勤人员，他们的待遇除职权不同外，收入和公务员完全一致。
