gtf转录起始位点

gtf转录起始位点？

这个基因的名字为EDEN，位置从1000 到9000。它编码生成了三个可变剪切转录本，分别为EDEN1，EDEN2 和EDEN3，而EDEN3有两个可选翻译起始位点，生成两个编码蛋白序列CDS1和CDS2。位于EDEN1和 EDEN2上游50bp的转录起始位点还有一个转录因子结合位点。

1原核生物的转录起始过程。

转录即DNA指导下RNA的合成，转录起始过程形成第一个磷酸间磷酸二酯键。RNA聚合酶的一个因子专门辨认模板DNA上的起始位点，使DNA聚合酶全酶结合在起始位点上，形成起始全酶DNA－复合物，从而开始“起始反应”。转录开始此因子即从复合物上脱落，有核心酶催化RNA的合成。（那因子叫C各嘛，我不会打）

2原核生物蛋白质蛋白质合成与真核生物蛋白质合成的异同点。

相同点：酶的性质相同，过程相似。

不同点：原核形成的MRNA为多顺反子，RNA聚合酶只有一种，以操纵子为转录的单位。真核形成的MRNA为单顺反子，RNA聚合酶有三种，转录时不涉及操纵子。

一、原核生物启动子：

在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落

例如大肠杆菌色氨酸操纵子后尾含有40bp的GC丰富区,其后紧跟AT丰富区,这就是转录终止子的结构

终止子有强、弱之分,强终止子含有反向重复顺序,可形成茎环结构,其后面为polyT结构,这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止

而弱终止子尽管也有反向重复序列,但无polyT结构,需要有终止蛋白参与才能使转录终止

典型转录终止子的特征：茎环结构,富含GC；含4个以上的U

原核生物启动子序列包括：CAP序列,增强聚合酶的结合和转录的起始序列（-70~-40）；识别区（-35）；解旋区（-10）；转录起始位（+1）

二、真核生物启动子：

启动子（promoter）：真核基因启动子是在基因转录起始位点（+ 1）及其5’上游近端大约100~200bp以内（或下游100bp）的一组具有独立功能的DNA序列,每个元件长度约为7~20bp,是决定RNA聚合酶转录起始和转录频率的关键元件

启动子包括：A核心启动子（core promoter）：是指足以使RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列其中包括转录起始位点或起始子（initiator）（+1）：一般是A或G及转录起始位点上游-25/-30bp处富含TA的典型元件TATA框

B上游启动子元件(upstream promoter element,UPE)：包括通常-70bp附近的CAAT框：GGCCAATCT和GC框：GGGCGG等,能通过TFⅡ-D复合物调节转录起始的频率,提高转录效率

你看自己做的那个物种有没有基因组序列，如果有在NCBI中先找到自己要做的基因，然后找到基因组序列，做blast后在基因组上选取上游的大概1000多个碱基，然后用软件分析，一般就找到转录起始位点了，转录起始位点也就在启动子位置。如果没有基因组序列，就比较麻烦，需要用染色体位移技术，先克隆到哪个序列，在用软件做分析。用软件分析后，还需要用实验验证，才能完全确定你需要的转录起始位点。

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