微生物的分类是根据形态特征、生理生化特征、生态习性、血清学反应、吞噬反应、细胞壁组成、红外吸收光谱、GC含量、DNA杂合性、核糖体核糖核酸相关性、rRNA的碱基序列。
微生物是一大类生物，包括细菌、病毒、真菌、一些小型原生动物、微藻等。他们是小个体，与人类关系密切。它涵盖了多种利与弊，涉及食品、医药、工农业、环保、体育等诸多领域。
