两者肯定有本质区别。一个是政府机关(县劳务输出办)，一个是劳务派遣公司(民营企业)。
首先，县劳务输出办事处一般属于挂牌机构，这里的工作人员都是政府工作人员，大部分机构都是临时机构。他们的主要职责是组织县内劳动力在特定时段外出打工。一旦过了这段时间，就没什么可做的了。比如这次疫情，各县的劳务输出办要组织劳动力，联系需要劳动力的地方政府，组织劳务输出。
其次，劳务派遣公司作为营利性企业，一般在自己手中掌握着一定的人力资源(不限于农民工)，帮助用人单位招聘，并从中提取报酬。当然，也有人力资源公司直接给被派遣劳动者发工资，企业只是向派遣公司购买服务。
最后，由于机构改革，一些国有劳务派遣公司会加上县劳务输出办的牌子，这种情况并不多见。
这就是我所知道的。希望对你有帮助。
