根据剧中的描述,玛丽被处死是因为沃尔辛汉姆试图保护伊丽莎白的王位。女王枢密院大臣沃尔辛汉姆(Walsingham)为建立特务机构付出了巨大努力。为了伊丽莎白的王位安全,他多次请求女王下令处死玛丽,而玛丽总是犹豫不决。最终,沃尔辛汉姆声称掌握了确凿的证据,并迫使女王签署命令,再次杀死她的王室成员。事后,女王表示后悔,斥责她的官员欺骗自己,也有人怀疑沃尔辛汉姆是伪造的证书,玛丽是无辜的受害者。玛丽在法庭上公开否认自己有罪。