不请自来这个问题不难说清楚。
自从钢铁侠3之后，托尼胸腔里的反应堆就不再是救命设备了。在接下来的故事线中，反应堆依然在原来的位置，只是需要给盔甲供电和他自己的习惯。为什么这么说？首先，我们需要梳理一下题主问题中涉及的故事线顺序。托尼从职业军火商到侠客钢铁侠的转变是从钢铁侠开始的，然后经历了钢铁侠2中万科的复仇，之后加入了神盾局的复仇者计划，在复仇者联盟中参加了纽约战争。而《钢铁侠3》则是钢铁侠托尼在纽约战争后的故事，贯穿了托尼战后抑郁的全片，和小辣椒的感情故事。
因此，当然，托尼接受了手术，以移除一直威胁他生命的导弹碎片和他胸部的微型反应器来维持他的生命。《钢铁侠》中钢铁侠的诞生主要解释了托尼是如何一步步成为超级英雄的。当然，最重要的是解释一下胸腔微反应器的由来。
由于被自己研制的导弹击伤，大量导弹碎片被摄入体内，这些碎片会随着血液不断汇聚到心脏。为了延续生命，托尼在两侧肋骨之间的胸腔里安装了一个类似磁铁的装置，以防止弹片流入心脏进行吸附。
起初，绑架团伙为托尼安装的装置是由汽车电池供电的，但托尼突发奇想，用废弃的原材料还原父亲留下的反应器，为托尼摆脱困境、发明马克1号提供了能源支持。
自从在《钢铁侠3》中，为了安抚小辣椒的感情，托尼在解决了末日病毒的危机后，毅然开启了“末日党”，用他的马克大军燃放烟花让小辣椒开心。(宇哥在这里感觉挺失败的，不要送我了。)危机过后，他也毅然接受了中国的医疗援助。手术后，他取出了所有威胁他多年的弹片，当然还有胸腔里的微型反应器。
所以问题来了。现在都取出来了，那么《复仇者联盟2》和《复仇者联盟3》后期托尼胸腔里的反应堆呢？宇哥个人认为有以下几种可能。
习惯上知道从钢铁侠到钢铁侠2，再到复仇者联盟，最后到钢铁侠3，看似不需要多久，但电影里的托尼是相当长的时间，从马克1到钢铁侠3里马克的军队，不知道要多久才能看完。在此期间，反应堆作为托尼生存的救命神器，早已习惯了它的存在。更有甚者，在《钢铁侠》中，佩珀曾经把废弃的反应堆比作托尼的心脏，作为礼物还给了托尼，也机缘巧合的救了托尼，缓解了《钢铁侠》中的危机。
但无论是他的依赖习惯，还是微反应器本身所附带的某种深层意义，这些都会让托尼更习惯于把微反应器放回原来的位置。
技术限制你要知道托尼发明的反战机甲是当时世界上最强大的战争武器，可以说领先世界其他国家几十年。技术难度不言而喻。当然，我们也不难从钢铁侠及后续系列中调试研发的细节中发现托尼机甲的精准度。之后随着Mark系列的不断更新升级，其功能也越来越强大。
越来越强大的装甲，越来越小的体积，可想而知其技术难度。从最初的Mark设计来看，微反应器一直是在胸部位置，而在Mark 3之后，胸部的反应器是能量爆炸的一种主要攻击手段。为了考虑其他功能而改变反应器的位置并不容易。所以这可能是托尼之后反应堆还在胸腔里的原因之一。
自恋
在《钢铁侠2》中黑寡妇对托尼的一份评价报告中，托尼被判定为不折不扣的超级自恋狂，托尼也很乐意承认这一点。《钢铁侠3》中，托尼向小男孩证明自己身份的时候，一个是穿过死甲，一个是胸中的反应器。如你所见，钢铁侠盔甲和胸膛里的反应堆已经成为托尼的标识和象征。
所以，超级自恋的托尼会继续参观自己显眼的胸部里闪闪发光的反应堆，炫耀自己，也就不足为奇了。
其他用途
最重要的是，托尼只是一个有天赋的正常人类，没有盔甲，相当脆弱。他总是穿着反应器或盔甲，他对缺乏安全感的托尼很无助。
更何况在《复仇者联盟3》中，反应堆不再是单一的能量装置。新一代Mark 50nm装甲，而胸腔里的反应器就是纳米材料的储存装置。对于这一点，托尼炫耀了自己。这也让反应堆变得更加重要，托尼把它放在胸前触手可及，以便随时投入战斗，也无可厚非。
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