所谓“黑匣子”，是指那些既不能打开，也不能从外部直接观察的系统。比如人的大脑只能通过信息的输入输出来确定其结构和参数。“黑箱方法”为人们从综合的角度认识事物提供了重要的途径，特别是对于一些内部结构复杂的系统，对于那些人的力量至今无法分解的系统，黑箱理论提供的研究方法是非常有效的。黑箱理论的前身，几千年前的中医理论，是“黑箱”理论的翻版。两者的科学结合将推动中药现代化和“黑箱”理论的进一步发展。黑箱理论的实践证明，物质具有系统属性，我们所有的科学研究对象都可以将其视为由基本要素构成的动态系统。在这个系统内外，不仅有信息的传递和交换，还有信息的处理和控制。与功能模拟法一样，系统整体优化法也是信息分析与综合方法的重要发展和实用化。在分析和综合任何系统的信息时，一方面要把握功能的相似性，另一方面要把握系统的整体优化方法，这是信息分析和综合方法的两个实施规则。只有遵循这两条规律，才能做出最好的信息分析和综合。
