《鹿邑公》的主人公韦小宝是扬州妓女韦春花的儿子。他从小在妓院长大，从小就听着去听歌剧。他羡慕歌剧中的英雄。为了成为一个英雄，他用一瞬间的勇气救了毛这个倒下的江湖英雄。为了感激的帮助，毛因他的纠缠而把他带到了首都。在北京，韦小宝被一老一小两个太监抢进了皇宫。他用诡计弄瞎了老太监海大夫，杀了小太监小贵子。从此，他在宫里假扮假太监。一天，韦小宝赌博归来，遇到一个自称小玄子的衣冠楚楚的少年，正在练武，于是和他交上了手。这个年轻人就是叶璇，康熙皇帝。
生活大臣鳌拜嫉妒年轻的康熙的武功和对高震的功勋。为了除掉鳌拜，康熙巧妙地设计了一个方案，让韦小宝带领一帮小太监，以摔跤的名义，活捉并杀死了鳌拜。韦小宝明智地杀了汉奸鳌拜，清帝当然是心悦诚服，反清团伙组织天地会也对他绿了眼。于是13岁的韦小宝成了天地会总舵手陈近南的关门弟子，天地会高层青木堂的香火大师。
陈近南命令韦小宝秘密回到皇宫。有一次，他爆料了皇太后勾结恶帮神龙派的秘密，从她那里得到了康熙的父亲顺治已经在五台山出家的消息。为了防止皇太后对小玄子做出伤害，他把这件事连同他是假太监的事实告诉了康熙。当康熙听说他的父亲还活着时，他又惊又喜，立即派韦小宝去五台山参观。在银行家的机缘下，韦小宝遇到了他一生中的知己双儿。之后前往五台山梁青寺拜见顺治老皇帝，但在返回途中被神龙派劫至辽东蛇岛。在蛇岛韦小宝神龙帮内讧之际，神龙帮头目洪安通被他的阿谀奉承所迷惑，成为了神龙帮的白龙使，在神龙帮中地位很高。
回到首都韦小宝后，我向康熙汇报了顺治出家的事情。希望皇上给我四个问题，康熙夸了他一顿，就命令他去少林寺出家。十几岁的韦小宝随80多岁的少林寺方丈成为“慧明禅师”。“高僧”韦小宝在寺庙里无聊到要闹事。他纵酒嫖娼，屡犯戒律，悄悄把一座千年古刹和佛教搞得一塌糊涂。
西王吴三桂在云南打拼，势力渐强，康熙决定武力撤藩。起义前，为了麻痹吴三桂，康熙决定将妹妹建宁公主嫁给吴三桂的儿子吴熊英。就在韦小宝“出家”期满之际，康熙为自己的使命做了一个“婚姻使者”。韦小宝护送建宁公主到云南，他们认识了。在他们到达云南之前，他们有过一段恋情。在昆明，与关系热络的拒绝嫁给，当她的兽性爆发时，她阉割了。当看到这一事件，他不得不举行吴人质，并返回北京与周围湖广。
不久，韦小宝奉命打击与吴三桂、罗刹勾结的神龙派。他率领水陆两路大军浩浩荡荡杀向辽东，还没到蛇岛，就成了大将军洪安通的俘虏。
