从整体实力来说，工信部的高校比不上教育部，因为清华、北大等顶尖高校都属于教育部。但是工信部的大学有一个方面的优势，专业性比较强。高校的优劣要综合评判，不能简单定性。
差异:
工信部所属高校基本都是理工科专业，比如北京理工大学、哈尔滨工业大学、北航空航空航天大学、西北工业大学等。
教育部直属高校以综合性大学、理工科大学、医科大学为主。
中华人民共和国工业和信息化部直属高等学校(中华人民共和国工业和信息化部直属高校)是指中华人民共和国工业和信息化部直属的若干高等学校，是中央部门直属高等学校的重要组成部分。
历史的发展
根据《国务院关于进一步调整国务院部门(单位)所属学校管理体制和布局结构的决定》(国发〔1999〕26号)，国防科工委继续管理所属学校。
根据2008年3月15日第十一届全国人民代表大会第一次会议通过的《关于国务院机构改革的决定》，不再保留“国防科学技术工业委员会”的机构设置；原国防科工委除核电管理外的所有职责划入新成立的中华人民共和国工业和信息化部，原国防科工委直属高校划入中华人民共和国工业和信息化部管理。
