1946年3月17日，戴笠在从北平到上海，再到南京的途中，因飞机失事身亡。
关于戴笠的死，有好几个传说。
蒋介石谋杀了戴笠。
3月17日下午，当毛仁凤发来“戴笠及其专机神秘失踪”的询问电报时，马汉三才松了一口气，放下了心。一个极其强大的对手终于被他的闪电击中，击倒在地。
戴笠死后，蒋介石并没有废除军事特务机构，而是将国民党军事委员会调查统计局改名为保密局。
1948年9月，马汉三和刘玉柱在南京被秘密处决。耐人寻味的是，执行死刑的罪名不是谋杀，而是贪污。
2.被美国特工谋杀
1945年，日本投降后，美国战略情报局的一名间谍听说戴笠要清洗和屠杀所有过去与日本人合作的中国人。情报局的所有人都认为这将是一场毫无意义的大屠杀，这场愚蠢的屠杀必须停止。
战略服务办公室在接到戴笠将在青岛过夜并于次日飞往上海的情报后，迅速指示美国驻青岛特工人员秘密修复戴笠专机气压计的保险丝。
然而，时至今日，60年前南京空神秘的飞机失事仍然是一个悬案，一代杀手戴笠的死因之谜仍然没有准确的答案。
