作者小可
来自Magda Bienko、karolinska institutet、Nicola Crosetto等机构的研究人员。利用GPSeq技术揭示了细胞核染色质的放射状结构。
这项研究成果于2020年5月25日在线发表在《自然-生物技术》杂志上。
研究人员报道了通过测序定位基因位点的方法(GPSeq)，这是一种全基因组的方法，可以推断整个核半径上核纤维层的距离。
GPSeq依靠染色质从核纤维层到核中心的逐步限制性消化，然后对产生的切割位点进行测序。
利用GPSeq，研究人员绘制了分辨率为100 kb的人类基因组径向组织图，从而揭示了基因组和表观基因组的特征和基因表达，以及A和B区室的径向模式。
通过将径向信息与Hi-C测量的染色体接触频率相结合，研究人员大大提高了全基因组结构建模的准确性。
最后，研究人员绘制了DNA双链断裂、种系突变和癌症突变的径向拓扑图，发现它们在A和B区室中具有独特的径向排列。
研究人员认为，GPSeq可以揭示基因组结构的基本信息。
据报道，哺乳动物细胞中染色质的径向结构在很大程度上仍然是未知的，除了与核纤维层相关的结构域。
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