水循环的影响因素主要有气象条件和地理条件。气象条件一般指风向、风速、湿度、温度和大气环流。地理条件一般指地形、土壤、地质、植被。
修建水库、开凿运河、渠道、过度开采利用地下水等人类行为改变了水原来的径流路线。
农业的发展和森林植被的破坏会引起水分蒸发、径流、渗透等过程的变化。城市和工矿区的空气污染和热岛效应也可能改变各个地区的水循环。