过氧乙酸的制备方法有很多。例如，可以使用乙酸钴和酒石酸钴作为催化剂，丙酮或乙酸乙酯作为溶剂，将催化剂、溶剂和乙醛溶液倒入不锈钢反应器中，然后向其中通入空气体，因此可以产生过乙酸。
构型过乙酸可以通过乙醛的直接氧化来制备。具体操作方法是以乙酸钴和酒石酸钴为催化剂，丙酮或乙酸乙酯为溶剂。将催化剂、溶剂和乙醛溶液倒入不锈钢反应釜后，通入空气体，乙醛将被氧化成过氧乙酸。
醋酸和双氧水在硫酸的作用下会发生反应。此时可以用8%的磷酸作为稳定剂，然后将冰醋酸和2/3的双氧水混合搅拌30分钟，再加入双氧水和浓硫酸继续搅拌反应3小时左右。最后加入少量8-羟基喹啉，搅拌静置75小时，得到过氧乙酸。
1份30%过氧化氢和3份冰醋酸在硫酸存在下反应，再用醋酸稀释，也可得到过氧醋酸。但是这种醋酸中的硫酸在使用时需要去除。去除硫酸的方法是加入乙酸钠中和。
