三峡淹没的水下城市有:巫峡镇、沙河、永安镇、汉丰镇、名山镇、贵州镇、莱文镇、新岭镇、云阳镇、万州区、涪陵区、忠县中州镇、城关镇。这些城市有的完全被淹没，有的部分被淹没。
三峡大坝建设中淹没的区域统称为三峡库区，面积7.9万平方公里，淹没田地1.94万公顷。
总共有1，171，500人被转移到洪水淹没的地区。移民安置是三峡水库建设首先要解决的问题。
