1、镇江站在市区，运行的是沪宁城际铁路上的车次镇江南站距离市区很远，运行的是京沪高速铁路上的车次。
2、镇江高铁站和镇江南站是不同的高铁站，镇江站是在沪宁城际线上的，镇江南站是在京沪高铁线上的。镇江站在老火车站北面，万达广场对面，镇江南站是在丹徒的312国道边上。
拓展资料：
1、高铁站，全称高速铁路车站，是指在高速铁路沿途建设、主要为高速列车服务的火车站。不过，包括中国在内的多个高速铁路技术强国都没有明确的高铁站说法，高铁站是一种泛而博的非严谨铁路术语。
2、判断一座火车站是否属于高铁站，主要参考该车站是否位于高速铁路沿线以及是否为日常的高速列车服务。高速铁路（含部分高级快速铁路）的设计速度标准是不低于200km/h。
3、中国国家铁路车站中没有任何以“高铁”两字命名的火车站，所有国铁车站均由国家铁道部（今中国铁路总公司和国家铁路局）统一管理运营。
4、由于我国不断加快普速铁路升级改造和高速铁路广泛建设，中国高铁站逐渐在神州大地上星罗棋布。
5、中国的高铁站由旧车站和新车站两大部分组成。旧高铁站是为了配合普速铁路提速工程在既有车站基础上升级改造而来的具备提供高速列车日常停靠上落乘客业务的火车站，如北京西站。新高铁站是新建（京津城际铁路及其之后建成的）设计速度达每小时200千米以上铁路的客运站或客货站，如广州南站。
参考资料：百度百科：高铁站
镇江南站和镇江站的区别是面积不同，位置不同，站场规模不同。
1、面积不同
镇江南站：镇江南站站房建筑面积5993平方米，镇江南站站房分作两层：一层候车站厅，二层有两个站台。
镇江站：镇江站总建筑面积1.4万平方米，室内面积3500余平方米，旅客进出站采用上进下出的形式，候车室面积在2300余平方米，售票厅面积400余平方米。
2、位置不同
镇江南站：镇江南站位于江苏省镇江市丹徒区站前北路，隶属中国铁路上海局集团有限公司管辖，是京沪高速铁路的中间站。
镇江站：镇江站位于江苏省镇江市润州区中山西路73号，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的一等站，是镇江市重要的交通枢纽之一，也是京沪铁路和沪宁城际铁路的中间站。
3、站场规模不同
镇江南站：镇江南站站场规模为2台6线，其中正线2条，到发线4条；站台为双岛式，站台层标高为13.75米，途经线路是京沪高速铁路。
镇江站：镇江站站场分为普速场和城际场，规模为5台11线。其中，普速场位于车站北侧，站场规模为3台5线；城际场位于车站南侧，站场规模为2台6线，其中正线2条，到发线4条，站台为双岛式。
以上内容参考 百度百科-镇江南站
以上内容参考 百度百科-镇江站
