目前南宁市有5条地铁线路正在运行，这5条地铁线路的运行时间是一样的，早晨首班车的发车时间都是6:30，末班车都是到晚上的23点。
不过要注意，在不同时间段，不同列车之间的间隔时间是不一样的。比如1号线，工作日早高峰时间段，石埠站前往火车东站方向，发车间隔时间由原先的5分钟会缩短到4分20秒。2号线工作日早高峰和晚高峰，行车间隔时间是6分钟，非高峰时间段行车的间隔时间是8分钟。
南宁第1条线路是在2016年的6月份正式开通运行，这条线路的开通运行也让广西壮族自治区成为第1个开通地铁的少数民族自治区，具有不一样的意义。现在南宁的轨道交通运行总里程数达到了128千米，设有104座车站。
便民出行
乘客们乘坐南宁地铁的时候，如果持有的是南宁市民卡，可以享受到9折优惠的，而且在持卡乘坐公交车90分钟内，换乘轨道交通可以享受到8.5折的优惠，另外还可以购买常规的单程票，这种票是没有任何优惠的。
南宁地铁的开通对于南宁的经济发展是很有帮助的，完善了城市的功能，提升了这座城市的品位，让南宁市在现代化竞争中更具优势。南宁地铁的建设有助于市民们安全快捷出行，而且更环保，更绿色，缓解了城中心区的交通压力。
具体如下：
2019年6月6日，南宁轨道交通3号线运营时间与1、2号线保持一致，为06:30-23:00，全日行车间隔为8分钟，单程所需时间约48分钟。
客运流量
2017年4月7日，南宁轨道交通1号线迎来全线试运营百日，一共运送乘客2281.4万人次，日均客运量22.8万人次，南宁人平均每人坐3次；开行列车26307列，列车运行图兑现率100%，正点率99.99%。
2016年12月28日至2018年1月4日，1、2号线地铁共开行列车11.11万列次，正点率达到99.99%，共运送乘客10031.22万人次。1号线2017年10月1日客运量达到43.75万人次；12月31日1号线日客运量为54.48万人次，2号线日客运量22.60万人次，当日南宁地铁1、2号线单日总客运量高达77.08万人次。
