最後地铁开是晚上10:30，最后一班从上水开到落马洲站的车时22:11开出，皇岗口岸是24小时通关的。
红磡开往落马洲末班车时间为21:35分，红磡开往罗湖末班车时间为23:07分；
具体时间表请参阅港铁官方网站；
先计划你的地铁线路，由于你是要搭乘港铁回深圳，所以一定是搭乘东铁线，那么计划一下你在哪一个站点换乘东铁线最为方便，然后点击网站查看相关换乘站点开往落马洲或者罗湖的末班车时间，原则上比末班车提早5-10分钟到达站台为好；
另外，赶不上港铁末班车的话，可以选择全日通巴士回深圳，湾仔地铁站、太子都有上车站点，二十四小时通车，晚间23:00-6:00班次较少，大约10-30分钟一班车不定，港币四十元。
参考资料
港铁官方网站.港铁官方网站[引用时间2018-1-13]
也是分线路的 像港岛线和荃湾线这种一般都是到1点 其他的很多酒是12点左右。具体的还是分线http://www.mtr.com.hk/ch/customer/tourist/index.php这个是港铁的官网！你可以查询下，有路线和时间。查询港铁站，然后选你要从哪个站到哪个站，上面就会显示所需要的时间，以及首尾班车的时间！你看下lz所说的过关是指通过海关口岸的时间，还是从香港到到深圳各大通关口岸的时间呢？
香港机场快线到香港最晚是00：40左右，上环是00：30，其它的最后一班车都是在12点了。
皇岗口岸是24小时通关的，过关以后在00：30前还有少量公交车可以坐，之后就只能乘的士了；罗湖口岸是到00：00，通俗点说就是半夜12点，过关以后相对的公交车较多，不过一超过十二点半也就剩的士了；其余的口岸都是在十点半左右就关闭了。
