经查询，目前为止从肇庆东站没有开往普宁的直达列车，普客、高铁、动车都没有。
建议你在广州南站中转，换乘组合方案很多，路途时间还是比较短，路途换乘方案推荐如下：
1，19：16从肇庆东站出发，乘坐D3721次列车，20：00到达中转站广州南站，停留41分钟后于20：41同站换乘G6345次列车，22：48到达目的地普宁站。
本换乘方案全程历时3小时32分钟，二等座票价23.5+167.5=191元。
2，13：13从肇庆东站出发，乘坐G2929次列车，13：54到达中转站广州南站，停留46分钟后于14：40同站换乘G6313次列车，16：49到达目的地普宁站。
本换乘方案全程历时3小时36分钟，二等座票价28+167.5=195.5元。
3，19：07从肇庆东站出发，乘坐D2825次列车，19：50到达中转站广州南站，停留51分钟后于20：41同站换乘G6345次列车，22：48到达目的地普宁站。
本换乘方案全程历时3小时41分钟，二等座票价28+167.5=195.5元。
以上出行信息，仅供参考。
截止2016年9月，在揭阳没有高铁直达肇庆学院，可以先在揭阳普宁站乘坐D2281次列车 , 到深圳北站乘坐G4232次列车 , 在肇庆东站下车，从肇庆东站坐公交至肇庆学院，详情如下：
公交线路：k01路 → 25a路，全程约30.0公里
1、从肇庆东站乘坐k01路,经过4站, 到达大冲站
2、步行约40米,到达大冲站
3、乘坐25a路,经过8站, 到达肇庆学院
个人意见，仅供参考
汽车的话，你打电话或到汽车站去咨询（因为汽车的时刻表在网上有点混乱）
高铁火车的话，在普宁站乘坐高铁到达广州南站，之后有两种换乘方式（：
1、你可以在广州南换乘，但是在广州南站乘坐动车到达的是肇庆东站（离你学校很远）。你到达肇庆东站后还要换乘2次公交（可以在地图上查询）。
2、你到达广州南站后，出站，乘坐广州地铁2号线到达广州火车站，在广州南站乘坐城轨到达肇庆站。在肇庆站出站后，步行到火车站公交车站乘坐肇庆11路公交车到沙街市场公交车站下车，再步行过去（可以在地图上查询）。
建议：第一次到学校报到，可能带的东西比较多。可以到学校的城市新生群询问是否有师兄姐有包车去学校，有的话可以坐包车去学校，就不用太麻烦。
如果你们还是自己去的话，在新生报到日，火车站、汽车站应该会有师兄姐会接待你们
以上是个人建议，仅供参考
