哈巴河清初为青色特启勒图盟新吐尔扈特蒙古游牧地，先属科属布多参赞大臣管辖，后属阿尔泰办事大臣治理。清光绪二十九年（1903年）设哈巴河屯局。民国元年（1912年）置哈巴河设治局。民国9年（1920年）改设县位，隶属布尔津县。民国19年（1930年）升格为县，先后隶属阿山道、第六行政区。中华人民共和国成立后相继隶属阿勒泰专区和阿勒泰地区。
境内地势由北向南倾斜，北部高山环绕，中部为丘陵，南部为平原。有额尔齐斯河、哈巴河、别列孜河和阿拉克别克河等河流。野生动物资源有紫貂、驼鹿、马鹿、鹅喉羚、野猪、狼、岩雷鸟等。野生药用植物资源有甘草、黄芪、麻黄、冬虫夏草等。水产资源有鲟鱼、哲罗鲑、细鳞鲑、长颌白鲑、编鱼、河鲇等20余种。已发现的矿产资源有铜、金、银、铅、锌、硫等。
该县畜牧业比较发达。畜牧业以草原放养为主，牲畜有羊、牛、马、猪等。农产品有小麦、油葵、芸豆、马铃薯等。工业有电力、采矿、畜产品加工、粮油加工及食品等门类。黄金生产发展较快，现已成为该县的支柱产业。阿黑吐别克口岸是经国务院批准开放的国家一类口岸。
矿产资源
哈巴河县地跨哈纳斯—忙代恰推覆体和喀拉额尔齐斯地槽褶皱带两个主要构造单元，地质构造复杂，沉积构造多样，岩浆活动较为频繁，成矿条件优越。目前已发现的矿种近30种，矿产地18处，其中大型矿床2处，中型矿床4处（其中一处为共生矿），小型矿床12处，矿化点、矿点71处。
（1）黑色金属矿产：目前在哈巴河县境内发现的铁、锰主要分布在黑汗呼都克、哈巴河中游西岸、别斯萨拉东、凯勒克赛依、达汗的黑、萨拉焦克、别斯铁热克、哈依北等地。
（2）有色金属矿产：目前县内发现阿舍勒一号大型铜矿和与其共生的锌为中型矿。在此矿种富含硫、金、镉、银，少量含有铅、镓等多种矿物元素。阿舍勒大型铜矿1号蚀变带呈近南北向分布，长2300米，宽50-400米，以硅片、绢云母化、黄铁矿化为主，一号矿床共圈出4个矿体，矿体长似层状，透镜状。据粗略估计有锌金属40.8万吨、铜含量91.9万吨，硫化铁含量1222.6万吨，金含量1.81万吨。此外，县内还有20余处铜矿点、痛矿化点，分布在那仁上游科尔恰特西、白哈巴、哈图河南公路旁、昆贵等地。
（3）贵金属矿产：贵金属矿产主要指的是金和银。县境内已发现原生金矿床3处、伴生金矿1处、砂金矿床2处、伴生银1处、原生金矿点4处，砂金矿点1处，伴生金银均在阿勒舍一号矿床内。目前，县内有五个较大的金矿区，分别是：多拉纳萨依金矿区、托库孜巴依金矿区、恰奔布拉克金矿、别列则克河砂金矿、喀拉塔斯砂金矿。此外县内还有8处金矿点、金矿化点。
（4）稀有金属矿产：县境内稀有金属矿产主要分布于北部山区，主要是伟晶岩型绿柱石、铌钽和锂云母，其次为稀有砂矿、独居石（已达工业品位）、磷钇矿、铌钇矿、铌锂矿。
（5）其他矿产：宝石、水晶在县内分布矿点较多，能达到一定规模的有7处；化工原料有伴生在阿舍勒一号铜矿内的钾长石、重晶石和硫；有粘土矿2处，规模为中等，在现有经济技术条件下可以开采利用。
矿产资源的开发与利用已经成为全县经济增长的亮点，尤其是阿舍勒一号铜矿的开发，使得全县铜的产量在2005年底达到1.5万吨以上，以采掘业为代表的第二产业在“十五”期间年均增幅达到43.5%，其已逐渐成为全县的支柱产业。
动植物资源
哈巴河县地域辽阔，地形复杂，动植物种类繁多，资源丰富。
（1）野生动物资源
①兽类：14科，其中有猞猁、扫雪、马鹿、赤狐、河狸、野山羊、紫貂、雪兔等。②禽类：34科，其中有天鹅、松鸡、雪鸡、金雕属珍稀类。③鱼类：9科，其中西伯利亚鲟、哲罗鲑、细鳞鲑、长颈白鲑等四种属额尔齐斯河名贵鱼种。④两栖类：7科9种。⑤昆虫类：39科100多种，多数为农林害虫。此外还有其他类动物几十种。
（2）植物资源
①森林植物：山区有原始森林、河谷有次生林，平原有荒漠林、树种达20-30种。其中西伯利亚冷杉、西伯利亚云杉、西伯利亚落叶松、西伯利亚红松属于国家珍稀植物。②牧草植物：因地理原因，形成了季节性草场，可划分为十个大类、二十九个亚类、八十一个草场型植物。③药用植物：境内有药用植物200余种，其中麻黄、柴胡、贝母、百合、百里香、沙参、党参、冬虫夏草等属于珍稀药材。
野生动植物资源是人类生产生活的重要物质基础，人类的衣食住行都与其密切相关。它还是重要的战略资源，保存着丰富的遗传基因多样性，为人类的生存与发展提供了广阔的空间。农业生物物种是千百年来，劳动人民通过对野生动植物物种不断驯化和选育的结果。加强野生动植物资源的保护和合理利用，对维护中国粮食与生态安全、促进农业和农村经济社会可持续发展、建设社会主义新农村具有十分重要的意义。
水资源
哈巴河县境内水资源丰富，河流、地下水、冰川和湖泊是其主要水资源载体。
（1）河流
全县有四条主要河流：即哈巴河、布列则克河、额尔齐斯河和阿拉克别克河。干流总长433公里，年径流量100.03亿立方米，全县人均水量123799立方米，是全国人均水量的27倍，是全疆人均水量的63倍。其丰富的水资源甚至可与江南水乡媲美。哈巴河纵贯县境南北，对全县经济和社会发展起着决定性作用。该河22年平均年流量21.53亿立米，年际水量变化不大而季度变化明显，一年中有丰水期和枯水期之分。5-9月份是丰水期，水量占全年78.08%达16.81亿立方米，与作物生长大量需水期相吻合，10月-翌年4月份是枯水期，水量4.39亿立方米，占全年水量21.92%。现仅开发利用3.78亿立方米，占来水总量的17.56%。全县共有余水95.94亿立方米，其中哈巴河余水17.75亿立方米，白白流往国外。由于水土组合地域分布不平衡，目前对水的开发有限，故灌溉草场面积不大，部分农田受到干旱威胁，冬季牲畜饮水困难等问题急待克服。
另据测哈巴河的水能蕴藏量为45万千瓦，开发水电潜力大，但水电开发仍处于起步阶段。在冬季，全县生产、生活用电均无保证，电力不足成为全县经济建设和社会发展的主要限制因素。哈巴河属额河水系，牵涉到分水的问题，有必要尽快加以解决。
（2）地下水
哈巴河县地下水资源丰富。在山区，由于降水和积雪融化，一部分汇入河流，一部分通过基岩裂隙补给了地下水，形成裂隙水。其中一部分以泉水形式流出直接补给河流，另一部分被引用灌溉。据测算，哈巴河县每年引用山间泉水灌溉面积约为0.3万亩，引用总量0.4亿立方米。
由于地势的差异，哈巴河县平原区水资源分布状况差异很大。河东平原地下水埋藏深度依地势而有差异，一般在0.5-2.0米之间，但随着季节的变化、灌溉的需要，地下水位也是在不断变化，其深度变幅在2-10米之间。河西平原地下水埋藏较深，一般在10-40米；而额尔齐斯河以南地区除利用一些基岩裂隙水和地下水埋藏较浅地区已打井解决了人畜饮水外，其他大片春秋草场地下水埋藏较深，深度一般在20米以上。目前，由于未系统的对全县地下水资源进行勘探，地下水储量尚不明确。
（3）冰川
阿尔泰山在冻土带以上，高山顶上终年积雪，有现代冰川390条，冰川总面积247.55平方公里，储冰量达147.93亿立方米，折合储水量133.14亿立方米。其中，哈巴河的上游及源头有冰川35条，冰川面积31.26平方公里，估算储水量16.81亿立方米，是哈巴河水量的稳定来源。冰川的下线分布着大片的冰沼原，面积400.4平方公里，储藏着大量的水源，对保持哈巴河水量的稳定起着重要作用。
（4）湖泊
境内有大小湖泊10余处，总面积1.73平方公里，折合2590亩，一般水深在0.5-6米之间。较大的湖泊有：却限湖，面积0.5平方公里、水深2.5米；阿忙拜湖，面积0.52平方公里、水深1米；阔尕勒库勒湖，面积0.2平方公里，平均水深1米。湖泊是发展渔业优势资源。
