高铁火车站晋江站共设有两座站台，其中基本站台一座，中间站台一座(每个站台有450米长、10.5米宽)，到发线三条，杭深正线两条。
下行动车停靠1号站台通往目的地站点：（杭深线）厦门北站，角美站，漳州站，漳浦站，云霄站，诏安站，饶平站，潮汕站，潮阳站，普宁站，葵潭站，陆丰站，汕尾站，鲘门站，惠东站，惠州南站，深圳坪山站，深圳北站（龙厦铁路）厦门站，漳州站，南靖站，龙山镇站，龙岩站，古田会址站，冠豸山站，长汀南站，瑞金站，会昌北站，于都站，赣州站
上行动车停靠2、3号站台通往目的地：（杭深线）泉州站，惠安站，仙游站，莆田站，涵江站，福清站，福州南站，连江站，罗源站，宁德站，福安站，霞浦站，太姥山站，福鼎站，苍南站，鳌江站，瑞安站，温州南站，永嘉站，乐清站，绅坊站，雁荡山站，温岭站，台州站，临海站，三门县站，宁海站，奉化站，宁波站，余姚北站，上虞北站，绍兴北站，杭州东站（沪昆高铁）上海虹桥站，松江南站，金山北站，嘉善南站，嘉兴南站，桐乡站，海宁西站，余杭站，杭州东站，诸暨站，义乌站，金华站，衢州站，江山站，上饶站，弋阳站，鹰潭北站，抚州东站，南昌西站，高安站，新余北站，宜春站，萍乡北站，长沙南站，湘潭北站，韶山南站，娄底南站，新化南站，怀化南站，玉屏东站，凯里南站，贵阳北站（沪宁高铁）昆山南站，苏州园区站，苏州站，无锡站，惠山站，常州站，丹阳站，镇江站，南京站（昌福线）永泰站，尤溪站，三明北站，将乐站，泰宁站，建宁县北站，南丰站，南城站，抚州站，南昌西站（昌九城际）南昌站，庐山站（武九铁路）黄石站，武汉站，汉口站（京福高铁）福州站，闽清北站，古田北站，南平北站，建瓯西站，武夷山东站，武夷山北站，五府山站，上饶站，德兴站，婺源站，黄山北站，歙县北站，绩溪北站，旌德站，泾县站，南陵站，铜陵北站，无为站，巢湖东站，长临河站，合肥南站，水家湖站，淮南东站，蚌埠南站，宿州东站，徐州东站，枣庄站，滕州东站，曲阜东站，泰安站，济南西站，德州东站，沧州西站，廊坊站，北京南站（胶济线）济南站，章丘站，淄博站，青州市站，潍坊站，高密站，青岛北站，青岛站。 关于2016春运加开动车的通知:
1月24日至2月6日，2月11日至3月3日，晋江站增加D6562次(厦门~南昌西)；
1月25日至2月7日，晋江站增加D9595次(三明北~厦门)；
2月3日至2月6日，晋江站增加D2325(福州南~深圳北)。
青岛到福建晋江没有直达的火车，需要倒车，具体方案如下：第1种方案：从 青岛 经 上海虹桥 到 晋江
出发车次 青岛发车 到达上海虹桥 旅行时间 旅行距离
G232/G229(青岛-上海虹桥) 09:26 16:12 6小时46分钟 1326
G224/G221(青岛-上海虹桥) 06:55 13:346小时39分钟 1375
G228/G225(青岛-上海虹桥) 13:55 20:26 6小时31分钟 1276
中转车次上海虹桥发车 到达晋江 旅行时间 旅行距离
D3201(上海虹桥-厦门) 08:06 16:09 8小时03分钟 1077
D3209(上海虹桥-厦门北) 10:2819:15 8小时47分钟 1077
D3119(上海虹桥-厦门北) 12:25 20:37 8小时12分钟 1078
第2种方案：从 青岛 经 福州 到 晋江
出发车次 青岛发车 到达福州 旅行时间 旅行距离
K70/K67(青岛-福州) 19:28 09:05 37小时37分钟 2375
中转车次 福州发车 到达晋江 旅行时间 旅行距离
D6259(福州-厦门) 16:01 17:32 1小时31分钟 199
D6251(福州-厦门) 13:52 15:21 1小时29分钟 199
D6267(福州-厦门) 19:23 20:52 1小时29分钟 199
D6237(福州-厦门) 10:15 11:43 1小时28分钟 -
D6241(福州-厦门) 10:40 12:09 1小时29分钟 199
D6227(福州-厦门) 08:49 10:07 1小时18分钟 199
D6215(福州-厦门北) 06:50 08:23 1小时33分钟 199
D6243(福州-厦门) 10:50 12:20 1小时30分钟 199
D6231(福州-厦门) 09:16 10:45 1小时29分钟 199
D6249(福州-厦门) 13:13 14:44 1小时31分钟 199
另外 在青岛四方长途站有一趟直达晋江的过路车，具体发车情况如下：
车 次 始发时间 检票口 余 票 里 程 整票价 车 型 终点站
T197 10:40 1030 2034 550.00元 高一卧铺 石狮
1、G242次列车是由厦门北开往青岛的高铁，列车全程：2043公里，运行时间：12小时41分钟。07：45分从厦门北始发，途径23个站，于20：26分到达终点站青岛站。
2、途经站：厦门北、晋江、泉州、福州、南平北、武夷山东、上饶、婺源、黄山北、绩溪北、旌德、南陵、铜陵北、无为、合肥南、淮南东、蚌埠南、徐州东、曲阜东、泰安、济南、淄博、潍坊、青岛北、青岛。
