我是西安人，南京我也去过。
这两个城市都是我国的文化古都，文化底蕴深厚。
①气候：西安是内陆城市比较干燥，南京地处江南，气候比较湿润。
相对而言，我觉得西安的夏天比较好，南京除了夏天太热外，其他时候气候比西安好。
②经济方面：南京和西安都是我国重要的工业城市，工业基础差不多，各有千秋。
但是南京位于长三角地区，区位优势很明显，发展速度比较快。
但是西安是我国西部主要的工业城市，随着西部大开发的加快，西安的工业发展步伐也很快，将来西部的经济中心地位已确立。
南京的消费水平比西安略微搞一点。
③国际知名度：西安和南京都是文化古都，但西安的建都史长，历史悠久，是世界四大故都之一，国际知名度高，很多国际政要、民间交流团体都把西安选择为必去的一站。
你要是稍稍留心就会发现，很多的重大活动都要来西安。
④科研实力两地相当，大专院校、科研院所很多，门类很齐全。
⑤西安是全国9大区域中心之一，南京因为临近上海，风头被上海盖过。
所以，就这两个城市而言，我觉得旗鼓相当，有一拼。
孰好孰坏要看你的则重点而言
各有各自的特色的。
都是曾经的古都，历史文化的底蕴沉淀都是浓厚的。
不过就本人来说，还是喜欢西安多些，因为除了几个著名的类似兵马俑之外，还有附近的华山可以去，也就是说，周游历史上的、人文风景上的，都是可以一起欣赏了。
南京周边也是江南景色的代表之地，比方说高铁动车或大巴很快就到达的~镇江、扬州、宜兴、常州、无锡、苏州
