昆山高铁有2条线路：
一是昆山至上海虹桥高铁，全长56公里，分为昆山站至沪宁线（包括昆山新城站、昆山站、昆山南站及其中间设站），以及沪宁线至上海虹桥线（包括江川站、鹿山站、张家港站、沪宁线、苏州新区站、苏州北站及其中间设站）。
二是昆山至江阴高铁，全长20.4公里，分为昆山站至江阴线（包括昆山新城站、昆山站及其中间设站）。
昆山高铁南站有直达苏州高铁北站的动车组。最新时刻表如下：车次
发站
发时
到站
到时
历时
硬座D182/D183昆山南7:48苏州北8:000:1210D86/D87昆山南8:22苏州北8:340:1210D36昆山南10:47苏州北10:590:1210D302昆山南14:04苏州北14:160:1220.5D254昆山南18:28苏州北18:400:1210D5432昆山南19:58苏州北20:100:1210
