区别为位置不同，代表车型不同。
一、位置不同：太原站，位于山西省太原市迎泽区建设南路2号，属于特等站。而太原南站位于山西省太原市小店区太榆路，是中国铁路太原局集团有限公司管辖的一等站。
二、车型不同：太原站是普通火车站，太原南是高铁站。太原站经停普速列车；太原南站主要经停高铁、动车，也经停个别车次的普速列车。
太原站与太原南站
太原站（Taiyuan Railway Station），位于中国山西省太原市，是中国铁路太原局集团有限公司管辖的特等站，途经线路包括包括南北同蒲铁路、石太铁路、太焦铁路、太中银铁路、太兴铁路、石太客运专线、大同-西安客运专线等。
太原南站（Taiyuannan Railway Station），位于中国山西省太原市，是中国铁路太原局集团有限公司管辖的一等站；是铁路“十一五”规划中石家庄至太原铁路客运专线的重要配套工程、太原市的标志建筑车站，也是山西省重要的交通枢纽之一。
太原南站于2008年12月28日开工建设；2010年2月4日，太原南站进入正式施工阶段；2013年8月20日，太原南站线路拨接施工完成；2014年7月1日，太原南站投入运营。2019年7月25日，太原南站东广场开通运营。
以上内容参考：百度百科——太原南站 百度百科——太原站
2条：分别为：大西高铁：分别发往大同与西安，其中，大西高铁太原南——西安北段目前已经投入运营，太原南——大同段目前仍在将射中
石太客运专线：发往石家庄，同时根据《国家高速铁路与城际辅助性客运专线中长期发展与规划纲要》（四纵四横高速铁路与城际客运专线干线网络）未来，石太客运专线将陆续延伸至济南，最终延伸至青岛，形成“四纵四横”干线中的青太客运专线。
