trizol 法提RNA怎样去多糖

信的格式怎么写2023-05-06  30

我本科毕业论文做的是SSH,需要提大量RNA,也碰到了

多糖

问题。其实trizol法提取总RNA很好,简单又节约时间,但是对于

植物材料

貌似不是很理想。当初我们改进了方法,用CTAB提取RNA的,然后增加了一步去多糖(提完RNA后)用025倍体积的

无水乙醇

和低

浓度

的盐将多糖沉淀,同时使RNA留在

溶液

中。然后再用异丙醇将RNA沉淀出来。其实当初我们参考了很多文献,貌似LiCl过夜沉淀RNA去除多糖效果比较理想的,只是耗时,你可以试一下。想当初,我们也是反复实验的。以上仅供你参考。。。如果想知道CTAB具体的方法,可以站内消息联系。另外,TAKARA公司有一种专门提取富含多糖组织中RNA的

试剂

,你也可以试一下。

(仅供参考)1ml就可以了,细胞的RNA提取比较容易,只要你提取过程能够保证不污染,RNA一般不会降解,质量也应该不错。如果要使浓度高一点,你可以稀释的时候少加点DEPC水,我不知道你是多少水稀释的,可以减少一下。

在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。若需暂时储存,则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,以避免RNase的作用。

1 提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10 ╳106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;

2 将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30C下放置5分钟;

3 在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加02ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放置2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离心15分钟;

4 取上层水相置于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加05ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放置10分钟,12000g(2℃~8℃)离心10分钟;

5 弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离心5分钟,弃上清;

6 让沉淀的RNA在室温下自然干燥;

用Rnase-free water 溶解RNA沉淀。

实验一:细胞中总RNA的提取及鉴定

一、目的:

掌握Trizol提取总RNA的原理和步骤,学习电泳鉴定总RNA的方法。

二、原理:

RNA是核酸,具有较好的水溶性。提取RNA首先破碎细胞,然后用提取液将RNA溶出,反复抽提去除蛋白质,加入乙醇沉淀RNA,将RNA沉淀溶解备用。

常用的试剂为Trizol,该试剂可以破坏细胞使RNA释放出来的同时,同时使RNA酶变性失活,保护RNA的完整性。Trizol的主要成分为异硫氰酸胍、酚和B-巯基乙醇,异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,并使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。提取中加入氯仿,主要用处是用来分相,加速有机相和水相的分层,上层为水相,PH 51左右,只有RNA分子留在水相,DNA分子沉淀在酚与溶液的界面。加入异丙醇,主要沉淀大分子rRNA和mRNA。最后加入乙醇主要是洗涤异丙醇,也可以溶解一部分蛋白,去除杂质。

判断RNA 的质量主要有两个标准,一是完整性(是否被降解),二是纯度。RNA的完整性主要通过电泳分析来阐明,未降解的总RNA电泳时在凝胶中会出现28S、18S和5S rRNA对应的条带,如果有DNA污染则在RNA后会发现基因组DNA对应的条带。RNA的纯度可以通过分光光度计进行测定的A260/A280值来判断。

三、步骤:

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