区别在于军委是最高的军事领导机构，国防部是负责掌管国防和军队事务的军事部门。
军委的主要职能是：直接领导全国武装力量。其组成人员由中国***中央委员会决定。
2国防部的职能：
（1）在组织上，一般设部长或大臣一人、副部长若干人，部长或大臣通常是中央政府和国防决策机构中的重要成员，由军官或文官担任，也有由总统或总理兼任的，部内通常设有若干业务部门。
（2）在职权上，多数国家的国防部全面负责国防事宜及各种武装组织的建设和作战指挥；有少数国家的只负责指挥和管理军队，或只负责军队的行政事务，还有仅负责外交事宜的。
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党的中央军委由主席、副主席、委员组成，实行主席负责制。 中国人民解放军的党组织，根据中央委员会的指示进行工作。中央军事委员会的政治工作机关是中国人民解放军中央军事委员会政治工作部，政治工作部负责管理军队中党的工作和政治工作。军队中党的组织体制和机构，由中央军事委员会作出规定。
中国***中央军事委员会-百度百科
国防部-百度百科
国家中央政府中负责掌管国防与军队事务的军事部门。通常隶属于政府首脑，也有直属武装力量最高统帅的。现在世界上绝大多数国家的中央政府都设有军事行政机关，但名称、职权和组织机构不完全一样。在名称上，多数国家称国防部，有少数国家称“人民武装力量部”、“军事部”、“防卫厅”或其他名称的。在组织上，一般设部长或大臣一人、副部长若干人，部长或大臣通常是中央政府和国防决策机构中的重要成员，由军官或文官担任，也有由总统或总理兼任的，部内通常设有若干业务部门。在职权上，多数国家的国防部全面负责国防事宜及各种武装组织的建设和作战指挥；有少数国家的只负责指挥和管理军队，或只负责军队的行政事务，还有仅负责外交事宜的。
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