在最早的时期，原始出现的单细胞生物会逐渐变成最原始的藻类植物，随着演变原来的单细胞逐渐进化成多细胞。水中的藻类逐渐的向陆地演变，变成了低等的苔藓。
随着地壳运动，海里的植物逐渐的演变进化成蕨类。之后蕨类植物会逐渐的演变成裸子植物，进而出现了最高级的植物，也就是被子植物。
一、藻类
在最早的时期，原始出现的单细胞生物会逐渐变成最原始的藻类植物，比如绿藻、蓝藻等，这些是起源在水中，非常依赖水，生长也是离不开水的。随着演变，原来的单细胞会逐渐进化成多细胞，结构逐渐的变多，也更加的复杂。
二、苔藓
水中的藻类逐渐的向陆地演变，变成了低等的苔藓，比如地衣之类的，它们适应环境的能力非常的强。
三、蕨类
随着地壳运动的进行，原本一些海洋会变成陆地，海里的植物逐渐的演变进化成蕨类。起初只是进化出的裸厥类，也没有叶片和根，只是依靠着假根着生在陆地上。之后会进化出茎干，也有了根部和叶片，但是生殖还是离不开水。
进化分类学派以麦尔（May）、辛普森（Simpson）等人为代表。这一学派基本接受支序学派通过支序分析重建系统发育的方法（即支序分析方法）。支序分类学派和进化分类学派是当今动物分类学界的主流，两个学派之间的分歧在以下几个方面；
1）进化分类学派认为建立系统关系时，单纯依靠血缘关系（即分支的顺序，不能完全概括在进化过程中出现的全部情况。尚需考虑到各分支之间的进化程度。
2）进化分类学派认为凡起源于一个共同祖先的类群，均为单系群或单源群。
3）在方法论上，进化分类学派认为生物分类学家的工作是要分出动物的实际具体类群，支序学派的方法带有过多的形式逻辑成分，先验性太强。
4）在分类系统的安排上，进化学派指出支序学派的做法中，编级的层次太多，致使系统过于臃肿，在实践中无法使用。
A 两栖类起源于古总鳍鱼，最早的两栖类是坚头类（鱼头螈）距今35亿年前的泥盆纪晚期，由于气候与地壳原因时大量的鱼类（肺鱼与总鳍鱼）要到陆地上生活。现代两栖类的共同祖先是无甲亚纲。
B 爬行类由古两栖类的坚头类（石炭纪末）演化而来（在古炭纪末期，地球发生强烈的造山运动，是气候变干燥甚至沙漠，使大量两栖类灭绝或是重新回到水中），最原始的爬行类是杯龙类（蜥蜴等），由杯龙类演化出的两大类群，即始鳄类（古生代二叠纪，大部分便是现代爬行类，除了鱼龙类）与盘龙类（石炭纪末期至二叠纪）。
C 鸟类在中生代侏罗纪从假鳄类演化而来，即起源于晚侏罗纪的小型兽脚类恐龙，始祖鸟和原鸟既有爬行类的特征也有鸟类的特征，是爬行类的向鸟类的过渡类型。现存鸟类是平胸总目、企鹅总目、突胸总目。
D 爬行类中盘龙类后代中一支叫兽齿类，具有哺乳类的特征，是哺乳动物的原祖。原兽亚纲（鸭嘴兽）是现存哺乳类中最原始的类群，具有一系列接近于爬行类和不同于高等哺乳类的特征；后兽亚纲（灰袋鼠）是比较低等的哺乳类，高等哺乳类群是真兽亚纲，分为18个目，都为现存种类。
从化石与达尔文进化学说来看，爬行类与现代两栖类都来源于古两栖类，而古代爬行类是现代爬行类、哺乳类和鸟类的共同祖先。从而得到与支序分类学不一样的系统树如下所示：
进化分类学
综上可以看出支序分类学与进化分类学的区别，也使我们更好地掌握动物的系统发育
这是从进化分类学上来讲生物的系统进化这是我自己以前写的,可能很不全面
生物进化（或叫演化）的动力，来自自然选择，遗传漂变等。变异为进化提供材料，自然选择筛选合适的变异，淘汰不合适的。这个只是很笼统的原理。
另外，进化在外部表现形式上（即地球的生命历史）呈现明显的进步性的规律，也就是书本上说的“由低等到高等，简答到复杂”的规律性，而不是随意的无规律的“演化”。
现在很多人开始反对“进化”而提倡“演化”，因为他们认为，生命的进化没有表现出“由低等到高等，简答到复杂”的规律性（即所谓的进步性）。他们甚至认为，这种说法是恩格斯为了迎合他哲学思想而错误的理解了达尔文的观点。
实际上，有一点生物学常识的人，都会发现，地球生命的演化历史，存在非常明显的进步性，一句话归纳，主要表现在：繁盛的类群，总是那些比较年轻的类群，总是那些形态上离祖先比较远的类群。或者说，变化小的类群，其繁盛程度最后总是会被变化大的类群超过。生物总体上，向着对环境的适应能力逐渐增强的趋势发展，在现象上，体现为，进化程度最高的生物类群，出现最晚，却总是最繁荣的。
例子很多：现存的种子植物中，被子植物是出现最晚（最年轻），离种子植物祖先差别最大，进化程度最高，且最繁盛的类群。而裸子植物相反。现存的维管植物中，种子植物是出现最晚，离维管植物祖先差别最大，进化程度最高，且最繁盛的类群。而蕨类相反。
动物中也很明显：有翅昆虫，是昆虫中是出现最晚（最年轻），离昆虫的共同祖先差别最大，进化程度最高，且最繁盛的类群。而无翅昆虫相反。羊膜卵动物是陆生四足动物中是出现最晚（最年轻），离陆生四足动物的共同祖先差别最大，进化程度最高，且最繁盛的类群。而两栖类相反。
更明显的例子：真核生物是生物中出现最晚（最年轻），离真核原核共同祖先差别最大，进化程度最高，且最繁盛的类群。而细菌相反（出现时间早的多，发展时间长的多，但是却没有真核生物繁荣，变化也比真核生物小得多）。
总之，例子不胜枚举。
演化过程如下：
一、无脊椎动物的演化历程。
地球上最早的动物是单细胞的原生动物。
多细胞动物是由原始的单细胞动物演变而来的。一般认为多细胞动物起源于原始的鞭毛虫类，因为它们有许多种类表现出向多细胞状态发展的倾向，如团藻、空球藻等。
二、脊椎动物的演化 。
脊椎动物的演化可以分为三个阶段：水中的演化，从水中到陆地的演化，两栖类、爬行类的演化，鸟类和哺乳类的演化。
1、鱼类的起源和演化。
原始有头类可分为两支。一支比较原始，无上下颌，如出现于古生代奥陶纪的甲胄鱼，兴盛于志留纪和泥盆纪，它们的身体外被笨重的骨甲，由于不能很好地适应，不久就被淘汰。现存的只有七腮鳗和盲鳗等少数，由于无上下颌，只好过着半寄生的生活。另一支产生了上下颌，能主动的生活，成为了鱼类的祖先。
2、两栖类、爬行类的起源和进化。
从水栖生活转入陆栖生活，因古总鳍鱼类具有内鼻孔，偶鳍的结构和五趾型的四肢相似，以后由于环境的变化，逐渐变为原始的两栖类。蚓螈为现代无尾目的祖先，而另一支壳椎类的两栖类，演化为现代的有尾目和无足目。
爬行动物是石炭纪末期由古代迷齿亚纲的始椎类两栖动物发展而来的。蜥螈（或称西蒙龙）有古代两栖类的许多特征，如颈部不明显，但其枕骨髁、脊柱和附肢骨与爬行类相似，可以算是两栖类和爬行类之间的类型。杯龙类似乎是爬行类祖先的基干，所以的各类爬行动物直接或间接的为杯龙类的后裔。
3、鸟类、哺乳类的起源和演化
鸟类和爬行类在形态上有许多相似的地方，如皮肤干燥，缺乏腺体，羽毛和鳞片同源，头骨都有一个枕骨髁，产大型的羊膜卵，体内受精等，可以说明其间的亲缘关系。
哺乳类的起源比鸟类早，是在古生代由原始爬行动物演化而来的。
进化，在生物学中是指种群里的遗传性状在世代之间的变化。
所谓性状是指基因的表现，在繁殖过程中，基因会经复制并传递到子代，基因的突变可使性状改变，进而造成个体之间的遗传变异。新性状又会因物种迁徙或是物种间的水平基因转移，而随着基因在种群中传递。当这些遗传变异受到非随机的自然选择或随机的遗传漂变影响，在种群中变得较为普遍或不再稀有时，就表示发生了进化。简略地说，进化的实质便是：种群基因频率的改变。
生物进化的总体趋势是：结构上是从简单到复杂，在生活环境上是从水生到陆生，在进化水平上是从低等到高等。
在研究生物的进化的过程中，化石是重要的证据，在越古老的地层中，挖掘出的化石所代表的生物，结构越简单，分类地位越低等，水生生物的化石也越多，在距今越近的地层中，挖掘出的化石所代表的生物，结构越复杂，分类地位越高等，陆生生物的化石也越多，因此生物进化的总体趋势是由低等到高等，由水生到陆生，由简单到复杂。
生物进化的历程：
(1)采用比较化石的研究方法;即比较不同类型动物的`化石在地层中出现的顺序，从而判断动物的脊椎动物进化的顺序是：鱼类→两栖类→爬行类→哺乳类。
(2)采用比较动物的形态和解剖特征的方法，通过对始祖鸟与现代鸟和爬行动物的形态和解剖特征的比较，说明鸟类起源于古代爬行类，始祖鸟是爬行动物向鸟类进化的中间过渡类型。
(3)利用组成生物体的一些重要物质的差异性来比较生物之间的亲缘关系的方法，表明人和黑猩猩的亲缘关系最近，马次之，果蝇和向日葵则较远。
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