主要区别在：有胚（具细胞分化的结构）的就是高等植物无胚形成的就是低等植物
低等植物主要包括藻类植物,主要特征是：生殖结构是单细胞,合子发育离开母体,不形成胚,因此叫无胚植物高等植物主要有苔藓、蕨类、种子植物,主要特征是：生殖结构是多细胞,合子发育时在母体内发育成胚,因此又叫有胚植物
植物学上，两者的划分标准主要是依据合子是否形成胚。有胚的就是高等植物。无胚形成的就是低等植物。
（PS：胚就是由受精卵发育而成，具细胞分化的结构。如被子植物的胚可分为胚芽、胚轴、胚根和胚乳等结构）
藻类植物是低等植物：生殖结构是单细胞，合子发育离开母体，不形成胚，故又叫无胚植物。
苔藓、蕨类、种子植物合称为高等植物：生殖结构是多细胞，合子发育时在母体内发育成胚，故又叫有胚植物。
从植物学的角度上，高等植物与低等植物的主要区别为合子是否形成胚胎，高等植物是有胚植物，低等植物是无胚植物。在形态机构上，高等植物结构复杂，有组织的分化和根茎叶的分化，是多细胞植物，而低等植物刚好相反。
高等植物与低等植物的主要区别
高等植物是早期低等植物为了适应环境不断的进化，从而演变成高等植物。高等植物主要分为裸子植物、被子植物、蕨类植物和苔藓植物这几类。植物的结构和形态较为复杂，有根、茎、叶的分化，所以光合作用比较强。
高等植物植物又被称作茎叶体植物，也就是有胚植物。植物的构造有组织分化，细胞和生殖器官较多，合子在母体内能够形成胚胎。蕨类的真蕨亚门和楔叶蕨亚门、苔藓类的苔纲和藓纲、种子类的松柏纲和红豆杉纲等植物都是高等植物。
低等植物一般在在形态上，有细胞壁和中心体，但没有根、茎、叶的分化，也没有组织分化，生殖器官为单细胞，合子发育会离开母体且没有形成胚胎。低等植物不进行光合作用，依靠有机物质生活，营养方式多为寄生或腐生。
低等植物也叫无胚植物，像藻类植物、菌类植物和地衣类植物都属于低等植物。藻类植物的种类较多，一般有绿藻门和红藻门等，菌类植物主要有细菌门、粘菌门和真菌门这三门。地衣门类植物是菌类植物和藻类植物的共生体。
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