如以甲作为母本,乙作为父本为正交；而用乙作为母本,甲作为父本的杂交为正交,正交和反交是相对而言．
遗传物质可在细胞核内和细胞质内,如果是甲做母本,那么子代的细胞内的细胞质遗传物质是甲的,如果乙做母本,那么子代的细胞内的细胞质遗传物质是乙的．正交与反交 的作用是：检验是细胞核遗传还是细胞质遗传
生物学实验中有自交、正交和反交等,它们的含义分别如下：自交：雌雄同体的植物自己的和自己受精
杂交：让2种不同品种但染色体数相同的植物或动物交配
测交：用有关基因全为隐性纯合体的个体与F1进行的杂交测交则是对基因组成的推断是否正确的一种检验形式,它是在明确目的要求下使用隐性纯合体进行的杂交,所以试验的意义是不同的在两因子杂种时,2组基因是连锁,还是独立的,从F2的分离比可以估算,但为了进一步验证,所以要进行测交试验因为从隐性纯合个体与F1杂交产生后代的表现型能反映出F1配子的基因型的种类及其比率
正交：人们习惯将外来品种 ( 如约克夏猪等 ) 公猪与当地品种 ( 如金华猪等 ) 母猪杂交 ,称为正交
反交：将本地品种公猪与外来品种母猪杂交称为反交
正交与反交的结果往往不间 ,一般杂种后代在某些性状上更趋向于母本品种 ,这是由于母体效应造成的
正交反交：表现型不同的两种个体甲和乙杂交，如果将甲作父本，乙作母本定为正交，那么以乙作父本，甲作母本为反交,其中,甲显隐性基因,乙显显性基因；（即显性为母本是正交，隐性为母本是反交）
杂交：不同基因型的个体之间交配，取得双亲基因重新组合的个体的方法。(这个是遗传学上的定义）
测交：未知基因型的个体（显示显性性状）和隐性纯合体亲本交配，用以确定此显性个体基因型。
生物学：基因型不同的两种个体甲和乙杂交，如果将甲作父本，乙作母本定为正交，那么以乙作父本，甲作母本为反交；反之，若乙作父本，甲作母本为正交，则甲作父本，乙作母本为反交
数学：向量α与β正交，记为α⊥β
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