1664年牛顿开始从事新的力学研究；1665年—1667年这两年是牛顿创造发明的高峰期。他先后创立了二项式定理、光的分解、流数法，还确立了第一、第二定律和引力定律的基本思想。1668年他和巴罗合作完成了《光学和几何学讲义》；1675年做了有名的“牛顿环”实验；1684年，牛顿在他的挚友哈雷的热情劝说和鼎力支持下，出版了巨著《自然哲学的数学原理》，宣告了牛顿力学的形成，影响遍布自然科学的所有领域。
作为一个科学家，牛顿是一个虔诚的基督徒，一生都是，不止晚年。而这必然影响到牛顿对世界的认知。
牛顿从未出生时，他的母亲哈拿就曾许愿，如果让自己能得一个儿子，将要让他一生都信奉于主。
因此牛顿的成长过程，从来都是有神论者，这和他世界顶级科学家的身份似乎不相符合。
牛顿奇怪的思想体系，实际和他接受的教育有关，牛顿攻读的大学恰恰是一个神学院内设的科学系。
在西方宗教思想中认为，上帝存在于万物之中，而人类学习科学的意义正在于寻找上帝的规律，也即科学。
因此，牛顿研究出牛顿力学，他的目标是通过自己的努力，找到上帝设置在万物中的规律。有种以此报效上帝的意思。在他看来，科学和上帝并不矛盾，相反，是有机统一的。
越到晚年，牛顿越来越察觉到，世界如此有序，好像有一双无形的手在操纵和梳理一切。他相信，世间万物正如牛顿力学所揭示的内容一样，都存在一定的规律和规则，他们内部彼此相连，是上帝安排了这一切。
牛顿曾经和一个无神论者聊关于宇宙星体的知识，无神论者说宇宙星体都是无意识，随机产生的，而牛顿说，按照牛顿力学，连一个小的星系都不会是随意产生的，何况是一个宇宙。
在牛顿的观念中，宇宙天体都是按照一定规律产生、发展和演变的，这正证明上帝的存在。
在当时，他并没有意识到，宇宙运转的规律可能正是世间万物自己的特性导致了这个世界现在的模样。
因此在晚年，随着年龄的增长，他更加确信上帝的存在，并希望通过自己的科学本领，去验证上帝的存在。他的这种心理驱动，可谓是一个基督徒对宗教的服务和贡献。
牛顿通过光通过棱镜的情形来观察光的性质。他在把实验装置装备好时，就会在棱镜后面的屏幕上产生光谱，这是一道彩虹。所谓“红移”与“蓝移”就是根据光谱位置来说的。
牛顿发现白光并不单纯，而且白光是最不单纯的光，白光可以分成多色，多色光又可以合成白光。
在宗教方面，牛顿持有一种极端的神论异端思想——反三位一体说。这比当时有一定市场的无神论更甚。三位一体主要讲的是，圣父圣子圣灵是一个神。牛顿认为三位一体说开始据于正统地位的时间即是罗马教廷开始堕落的开端，同时也是千年至福期的开始。所以，他将目光放在公元四世纪，着重探讨了三位一体起源的那段历史，写了许多相关的文章，还通过计算得出基督二世降世的时间再1643年左右，巧合的是，这个时间点与牛顿自己的生日很接近。他自知这些学说不宜公开发表，他还是在《自然哲学的数学原理》总释以及《光学》的30-31疑问中对其理解上帝的方式做了一些说明。
世界上的科学家是非常多的，他们所研究的成功对于社会国家的推展都是非常具有价值的，很多时候即便是今天也用着很多年前科学家所研究的理论，比如说牛顿就是历史上一位伟大的科学家，很多人会问牛顿在晚年的时候，研究了什么？说出来大家可能不太相信，但其实晚年的牛顿在研究“神学”，不过这个不是迷信的。
首先我们了解一下牛顿小时候的故事，小的时候牛顿这个人其实也是比较有趣的，但是就是喜欢对于自己不知道的问题但是感兴趣的经常问原理，很多老师对于这些东西只是知道怎么用，但是为什么会这样可是完全不知道的，所以经常把老师弄得很是懵，后来有一次牛顿坐在一个苹果树下看书，突然被一个苹果被砸中，结果就开始研究了起来，经常研究出了“万有引力定律”，简直是让人难以置信啊，要是我们被砸中估计就是直接把这个苹果给吃了。
而后来的牛顿也成功走向了科学家的道理，创造了现在都还在用的“经典力学”，我们学过初中物理就会知道牛顿对于近代物理的推进还有科学都是有巨大贡献的，但是晚年的牛顿开始想另外一个问题，为何说呢么自己研究的就是这样的呢，为什么这一切都是有联系的，最后牛顿认为背后肯定有一个至高无上的超级智慧体设计好的这一切，也就是“神学”了。
这个不属于迷信，我们所发现的科学为什么都是这样的定律，其实很可能就是一开始被设计好的，说不定我们的地球本身就有一个灵智存在的智慧体，一切都是被设计好的，只是我们看不出来而已，这就是牛顿晚年所研究的。
说起牛顿我相信大家都比我清楚他在世界进程之中的作用，被称为“百科全书式”的人才。他在力学，光学，数学，物理等诸多领域的贡献达到了史上最超前和最顶端的境地，可以说是让人难以想象和释怀的一个高度。
他将自己的一生都付诸在了对科学的探究和成果的证实之上，成为了世界十大人物之一。
他对科学的痴迷程度也在罕见的，据记载他没有结婚的原因就是因为牛顿每次谈恋爱的时候都是一脑子的学术理论和疑问，也就是无论走到哪里都在思考自己的疑问和着手解决的问题，这种专一的境界也是我们难以达到的。
我们都知道牛顿在26岁的时候已经为后来两百年的科学奠定了基础和开发研究的理论，但是让人难以理解的是就是这么一位非常先进的人物在晚年却致力于研究神学。虽然他是一位基督教徒也有记载称牛顿始终相信上帝存在但他更是一位先进的科学家，他对神学的半生研究也使牛顿给我们留下了更大的疑惑。
牛顿把宇宙想象成为了机械表，而转动的力量来源于宇宙的原始推力，那么宇宙的原始推力来源却被牛顿想象成为了上帝。为此牛顿也付出了半生的心血去研究上帝的存在，这不禁让人不得不相信牛顿应该发生神学之中奥秘。
据记载牛顿对于神学的研究留下了一百五十多万字的神学手稿，由于当时的社会主流已经脱离了神学所以就一直没有发表。当然后来也有人反对牛顿的上帝之说，认为宇宙的第一推力完全可以在物理框架之中解决而无需“神助”。
这也说明了牛顿在神学之上可能是浪费了很多时间也可能没有浪费时间，总之他那150多万字的手稿内容绝大部分也是至今没有公布于世，这也值得人们深思。不过在宗教的立场之上不得不说牛顿与伽利略和哥白尼等人相差很多，他只是反对但并没有表明自己的意志也是逊色很多。
牛顿对科学研究了:
艾萨克·牛顿（1643年1月4日—1727年3月31日）爵士，英国皇家学会会长，英国著名的物理学家，百科全书式的“全才”
他在1687年发表的论文《自然定律》里，对万有引力和三大运动定律进行了描述。这些描述奠定了此后三个世纪里物理世界的科学观点，并成为了现代工程学的基础。他通过论证开普勒行星运动定律与他的引力理论间的一致性，展示了地面物体与天体的运动都遵循着相同的自然定律；为太阳中心说提供了强有力的理论支持，并推动了科学革命。
在力学上，牛顿阐明了动量和角动量守恒的原理，提出牛顿运动定律。在光学上，他发明了反射望远镜，并基于对三棱镜将白光发散成可见光谱的观察，发展出了颜色理论。他还系统地表述了冷却定律，并研究了音速。
在数学上，牛顿与戈特弗里德·威廉·莱布尼茨分享了发展出微积分学的荣誉。他也证明了广义二项式定理，提出了“牛顿法”以趋近函数的零点，并为幂级数的研究做出了贡献。
在经济学上，牛顿提出金本位制度。
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