港澳通行证在公民所在地公安局的出入境管理处办理。
港澳通行证应当在公民所在地公安局的出入境管理处，或者户口所在地的分局出入境管理科进行办理。办理时要提供本人居民户口簿及复印件、居民身份证及复印件、一张小2寸半身免冠数码照片，除了照片之外其他都需要先准备好复印件。
往来港澳通行证，俗称双程证，是由中华人民共和国出入境管理局签发给中国内地居民，因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。
办理流程
1、申请人可先在网上提前预约申请，或直接到现场提出申请，并按照规定填写中国公民出入境证件申请表，准备好需要提交的相关证明材料。
2、申请人需要提交本人数码照片两张，可直接在现场进行拍照。
3、申请人在工作人员的指引下进行指纹采集或者核验指纹，16周岁以下的申请人是否采集指纹根据其监护人的意见确定，采集后拿号等待办理。
4、工作人员对申请人提交的材料进行初审，并出具缴费单给申请人。申请人到指定窗口缴纳办证及签注所需的费用，并领取回执单。
5、受理申请后，由省公安机关出入境管理机构负责制作电子港澳通行证，并将制作好的证件送回接受申请的出入境管理机构。申请人在制证完成后，到办理的出入境管理机构领取证件。
法律分析：港澳通行证在哪里办：护照和港澳通行证在县级以上公安局出入境管理局服务大厅办理。护照、港澳通行证、赴台证。办理流程：在户籍所在省市办理护照，本人携带身份证原件，在县级和县级以上公安局出入境管理处办理。办理程序为：1.排队拍照（即使预先准备也要拍照，因为护照使用的是电子照片，也可以现场打印）；2.填写申请表《中国公民因私出国（境）申请表》（贴有小二寸白底彩色）；3.排队轮号；4.轮到后，提交申请表，身份证，相片和拍照回执，留存指纹；5.交费；6.拿回执（一定要记得拿回执，这是领取护照的凭证）。跨省办理护照依然需要带户口本和户口本复印件。跨省办理护照一般需要你在所办理省份工作六个月以上（本人在当地的纳税及社保证明），或者你的直系家属在当地居住六个月以上（本人在当地的暂住证、或，和投靠人在当地的纳税及），同时需要和复印件用于跨省审核，办证期是三十天（在本省十五天）。
法律依据：《中华人民共和国出境入境管理法》 第十条 中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定。具体管理办法由国务院规定
【法律分析】：港澳通行证应当在公民所在地公安局的出入境管理处或者户口所在地的分局出入境管理科进行办理。办理时要提供本人居民户口簿及复印件、居民身份证及复印件、一张小2寸半身免冠数码照片(除 了照片之外其他都需要先准备好复印件)。需要注意的是，首次办理港澳通行证的必须由本人亲自办理，办理之后两周左右可以领取证件。
【法律依据】：《中华人民共和国出入境管理法》
第四条 公安部、外交部按照各自职责负责有关出境入境事务的管理。 中华人民共和国驻外使馆、领馆或者外交部委托的其他驻外机构（以下称驻外签证机关）负责在境外签发外国人入境签证。出入境边防检查机关负责实施出境入境边防检查。县级以上地方人民政府公安机关及其出入境管理机构负责外国人停留居留管理。 公安部、外交部可以在各自职责范围内委托县级以上地方人民政府公安机关出入境管理机构、县级以上地方人民政府外事部门受理外国人入境、停留居留申请。 公安部、外交部在出境入境事务管理中，应当加强沟通配合，并与国务院有关部门密切合作，按照各自职责分工，依法行使职权，承担责任。
第十条 中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定。具体管理办法由国务院规定。
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