飞机
乘坐去杭州萧山机场的航班，在出口机场大巴售票处购买到武康的车票，机场大巴停靠武康车站是德清汽车总站，之后欢唱113路或者201路前往莫干山，5月-次年1月是季节性旅游公交。
火车
乘坐火车到德清高铁站，杭州。南京方向经过德清的车次很多。不过上海到德清的每天只有7：27和18:18两趟，早晚各一班，可能对旅游的人来说不是很适合，但是如果形成只有，可以先到杭州黄成，在杭州杭州东前往德清的高铁动车有很多，十几分钟就到了，在到达德清高铁站之后，可以换乘公交113路或者111路前往莫干山。
长途大巴
几乎所有的省外长途大巴都是要停靠在德清汽车总站的，在到达之后可以乘坐113路或者201路公交前往莫干山。
德清高铁站、德清汽车总站、德清西站是德清的枢纽，从这三个地方出发的公交基本可以涵盖德清的乡镇。如果感觉换乘公交麻烦，在部分城区也是可以选择乘坐出租车，如果觉得麻烦，也可以选择人力三轮车和电动三轮车等，但是这些方式是到不了风景区门的。
自驾
上海方向：莫干山距上海大约240公里，自驾大鱼要3小时，高速从A8转S12后再走G25至德清出口沿S09到三莫线，之后就到达莫干山镇。
杭州方向：从杭宁高速德清出口沿S09至三莫线或104国道到达德清后沿S09至三莫线。
自驾车从上海出发走延安路高架，然后接沪青平公路，经青浦沿318国道行驶至湖州，沿湖州318国道过境线进入市区后再沿太湖路、外环北路、外环东路、环城南路、杭长桥南路行驶，出湖州市区后上104国道往杭州方向行驶，经鹿山、青山、埭溪、三桥埠进入德清县武康镇，沿武康镇志远路南行至春晖街后右行，接09（304）省道西行可至莫干湖景区，继续沿09（304）省道行驶可至莫干山风景区。
另外，在104国道三桥埠处右转，走次级公路，可至莫干山镇。
莫干山距上海约239公里，上海至莫干山镇行车约3小时。
沿途过路收费情况（普通小汽车）：
吴江收费站：30元（单向收费）；
平望收费站：10元（双向收费）；
湖州收费站：15元（双向收费）；
德清收费站：10元（双向收费）；
往返共计100元。
注：以上驾车信息仅供参考。
* 非自驾车
莫干山位于宣杭铁路（宣州-杭州）沿线，有火车通杭州，有汽车通往德清县城武康镇。
1、火车
从上海坐火车前往莫干山必须经由杭州中转，然后走宣杭铁路在莫干山站下车。
上海--杭州
K809次，07:21从上海站始发，09:49到达杭州
K821次，08:18从上海南站始发，10:06到杭州
杭州--莫干山
5137/5136次，08:15从杭州始发，09:33到莫干山站
2308/2305次，15:16从杭州始发，16:40到莫干山站
回程坐火车也需经杭州回上海。
杭州--上海
K810次，17:36从杭州发出，19:58抵达上海
K828次，18:21从杭州发出，20:09抵达上海南
莫干山--杭州
1708/1705次，15:30从莫干山发出，16:52抵达杭州
5138/5135次，16:22从莫干山发出，17:59抵达杭州
2、汽车
上海出发，可以先坐汽车到湖州。上海虬江路（老北站）长途汽车站每20分钟一班快客发往湖州，票价20元，车程约三小时左右；上海沪太路长途汽车站也有去湖州的汽车，每小时一班。再从湖州汽车站坐车到德清县城武康（车资8元）。 另外，坐火车到杭州后也可以再转汽车到武康，从杭州站可坐K555路到杭州汽车北站，再从那里坐汽车往德清县城武康（车资10元）。
德清县城武康到莫干山风景区车资8元。从湖州和杭州两地上山，行程约需1.5小时。
