有的家庭保存皮蛋，他们把皮蛋放在冰箱里甚至冷冻，以为可以保存很久不变质。其实恰恰相反，因为皮蛋是被碱性物质浸泡过的，所以鸡蛋里面的东西凝结成了果冻，含有70%左右的水分。结冰后，水会逐渐结冰。此时取出皮蛋食用时，冰块会逐渐融化，其胶状体会变成蜂窝状，改变了皮蛋原有的醇香风味，降低了食用价值。而且低温会让皮蛋颜色变黄，口感变硬，和正常的皮蛋有很大区别。
皮蛋的正确保存方法应该是:放入塑料袋中，密封保存，避免阳光直射，放在阴凉通风处。一般可以保存3个月左右而不改变风味。
另外，买过皮蛋的人都知道，皮蛋的外壳会蒙上一层灰泥，但不要觉得脏。这层泥很珍贵。这层泥其实是皮蛋浸泡的卤水粘上去的。是天然防腐剂，能起到保鲜保质的作用。想吃的时候再洗掉这层泥也不迟。
