究极绿宝石为绿宝石的改版。
绿宝石是第三世代中的第五部，也是第三世代的最后一部宝可梦系列游戏。
绿宝石虽然是红宝石蓝宝石的扩展作品，但是游戏系统部分采用了火红叶绿修改后的系统，因此图像部分反而和红宝石蓝宝石所差异。
肚脐岩和诞生之岛在火红叶绿中显示位于七之岛，而在绿宝石中在这两个地方打开地图依然会显示丰缘地区的地图，但不会显示在丰缘地区的任何一处。
绿宝石有切换昼夜的设定，但游戏内景观没有昼夜画面的区别，时钟系统内部有星期系统但游戏内却无法查看，昼夜划分也不是以真实的时间段来设定。
设计变化
背包道具上限提高。
道馆机关重新设计。部分地点场景改变了配色。如：流星瀑布。
将前作的对战塔扩大为新的对战开拓区。
除了水静市的华丽大赛会场，绿茵镇、凯那市和秋叶镇的会场都被对战帐篷取代。
新增加与火红叶绿一致的肚脐岩、诞生之岛，以及本作限定的边境的小岛三个地点，这三个地点都是用来捕获传说的宝可梦的地点。
传说的巨人的捕捉谜题变化，但是捕捉地点不变。
觉醒神殿不再是捕捉传说的宝可梦的地点，而是一个只能随剧情进入一次的地方。
由于剧情缘故天空之柱首次进入时被简化，但是第二次进入的难度与红宝石蓝宝石一致。
111号道路上的化石被放进了幻影之塔，仍然为二选一，但是另一块会在沙漠的地下道出现。
在各地游走的无限宝可梦变为随玩家选择的喜爱颜色决定，另一只则仍然位于南方孤岛。
热风在叶绿中是属于宠物的技能，不是技能机也不是通过人物学习的，除了喷火龙、卡蒂狗、火焰鸟和煤炭龟以外，其他精灵无法学习。1，pokemmo里喷火龙的热风属于该精灵的基本技能，无法通过升级学到，只能通过技能回忆才能够学习。2，回忆技能的地点在2岛上，要用1个大树果或2个小树果来换取，树果在派拉斯特和派拉特身上携带。3，在奥米西山的迷宫里可以遇到派拉斯。
官方新出的PvP模式，分为匹配赛与排位赛。匹配赛的胜负没有奖励与惩罚，排位赛获胜可以获得排位分、大量BP和胜点，战败会扣除排位分并获得少量BP。
排位赛三个月为一个赛季，每14天换一轮胜点奖励，每个赛季有一个10000胜点的终极奖励，赛季末排名前百的玩家会被允许参与赛季专属锦标赛，获胜的玩家可获得赛季专属皇冠。
