没有，2020年2月6日从南宁东到深圳北的高铁一直都是正常开行的。
根据12306官网查询结果显示，目前从南宁东开往深圳北每天有3趟直达高铁，另外还有一趟普速直达列车k1206，高铁车次时刻表如下:
1，G2911次，08:33从南宁东出发，12:01到达目的地深圳北，运行时间3小时28分，二等座票价248.5元，途中停靠梧州南，广州南。
2，G2913次，11:52从南宁东出发，15:52到达目的地深圳北，运行时间4小时0分，二等座票价248.5元，途中停靠贵港，梧州南，云浮东，肇庆东，佛山西，广州南。
3，G2917次，19:48从南宁东出发，23:34到达目的地深圳北，运行时间3小时46分，二等座票价243.5元，途中停靠贵港，梧州南，肇庆东，佛山西，广州南。
每天有3趟高铁。车次:G2911
发站:南宁东(07:50)
到站:深圳北(12:00)
历时:04:10
二等:243.5元
一等:302元
车次:G2913
发站:南宁东(11:38)
到站:深圳北(15:54)
历时:04:16
二等:243.5元
一等:302元
车次:G2915
发站:南宁东(18:00)
到站:深圳北(22:29)
历时:04:29
二等:243.5元
一等:302元
南宁东站，每天2趟高铁直达深圳北站：G2913次列车，每天08：00从南宁东出发，12：40到达深圳北。
G2911次列车，每天11：30从南宁东出发，16：19到达深圳北。
票价：商务座706元，一等座302元，二等座243.5元。
这是G2913次列车的全部站点：
01南宁东----08:00----
02贵港08:5008:522分钟
03桂平09:1609:182分钟
05梧州南10:0110:076分钟
06云浮东10:4710:5710分钟
07肇庆东11:2211:242分钟
08广州南12:0012:033分钟
09虎门12:2112:232分钟
10深圳北12:4012:40----
这是G2911次列车全部的站点：
01南宁东----11:30----
02贵港12:2012:222分钟
03桂平12:4612:482分钟
04平南南13:0313:052分钟
05藤县13:2813:302分钟
06梧州南13:4313:474分钟
07云浮东14:2714:292分钟
08肇庆东14:5414:562分钟
09三水南15:0815:102分钟
10广州南15:3815:424分钟
11虎门16:0016:022分钟
12深圳北16:1916:19----
