扬州东站和西站区别为：位置不同、通行车辆不同、管辖公司不同。
一、位置不同
1、扬州东站：扬州东站位于江苏省扬州市邗江区城北乡瓦窑村。
2、扬州西站：扬州西站座落于扬州市文昌西路530号。
二、通行车辆不同
1、扬州东站：扬州东站是扬州火车货运站，本站没有客运安排，只接受货物运输。
2、扬州西站：扬州西站是扬州汽车客运站。
三、管辖公司不同
1、扬州东站：扬州东站隶属中国铁路上海局集团有限公司（原上海铁路局）管辖。
2、扬州西站：扬州西站为江苏扬汽集团所属二级单位，由江苏扬汽集团管辖。
参考资料来源：
百度百科——扬州东站
百度百科——扬州汽车客运站
扬州西站和扬州火车站是不在一起的。扬州西站是汽车站，也叫西部交通客运枢纽，亦称扬州汽车西站、扬州汽车总站，需乘坐26路才可到达火车站，两者距离较近。
扬州火车站站址在扬州市邗江区，位于扬州新城西区文昌西路扬溧高速扬州西出口东约1公里处，距扬州市中心约8公里。车站总建筑面积20240平方米，工程于2003年7月18日开工，2004年4月18日竣工并投入运营。
