根据《郑徐客专可行性研究报告》，线路设计分为郑州－中牟、中牟－民权、民权－商丘、商丘－徐州几个区段，基本分为南线北线两个方案，南线大部分线路在连霍高速或陇海铁路以南，北线线路大部分在连霍高速或陇海铁路以北。
同时，郑徐客运专线已经确定了6个具体站点，分别为郑州东站（在建）、开封北站、兰考南站、民权站、商丘站、徐州东站（在建），商丘-徐州之间结合线路设站。郑徐客运专线与京沪高铁在徐州将共用徐州东站，从上海往徐州方向发出的高铁动车将在这里实现转换。
1——济南西——始发——07:26——无——无
2——泰安——07:43——07:46——3分——17分
3——滕州东——08:16——08:18——2分——50分
4——枣庄——08:31——08:33——2分——1小时5分
5——徐州东——08:51——09:07——16分——1小时25分
6——萧县北——09:25——09:31——6分——1小时59分
7——砀山南——09:50——10:00——10分——2小时24分
8——民权北——10:28——10:31——3分——3小时2分
9——兰考南——10:43——10:45——2分——3小时17分
10——郑州东——11:18——11:31——13分——3小时52分
11——许昌东——11:53——11:55——2分——4小时27分
12——漯河西——12:11——12:13——2分——4小时45分
13——信阳东——12:52——12:54——2分——5小时26分
14——孝感北——13:12——13:14——2分——5小时46分
15——武汉——13:45——14:03——18分——6小时19分
16——咸宁北——14:28——14:30——2分——7小时2分
17——汨罗东——15:15——15:17——2分——7小时49分
18——长沙南——15:36——15:40——4分——8小时10分
19——衡阳东——16:17——16:19——2分——8小时51分
20——韶关——17:18——17:20——2分——9小时52分
21——广州北——17:59——18:01——2分——10小时33分
22——广州南——18:23——18:28——5分——10小时57分
23——虎门——18:45——18:47——2分——11小时19分
24——深圳北——19:04——终点——无——11小时38分
