文昌鱼和武昌鱼的区别在于种类、形态、生活环境等。
种类:文昌鱼是文昌鱼科文昌鱼的总称，是一种海洋鱼类；武昌鱼，淡水鱼，属于鲤科、鲂亚科的鲂属。
外观:文昌鱼形似小鱼，无头，两端尖细，身体扁平，半透明状；武昌鱼外形扁平，背部隆起明显，头小嘴小。
生活环境:文昌鱼是一种海洋鱼类，主要生活在海里。在我国，文昌鱼分布于河北东部、青岛、烟台、厦门、合浦等沿海地区。武昌鱼是一种淡水鱼，生活在我国河流、池塘等淡水流域，特别是水生植物和岩石丰富的地方。
