南京各个线路地铁运营时间不同，具体的12条路线的运营时间如下。
线路运营时间和线路信息。
1，南京地铁1号线。
首末班车时间。迈皋桥05:42 - 23:19 | 中国药科大学05:47 - 23:27。
线路信息。新街口站换乘2号线，安德门站换乘10号线。
2，南京地铁2号线。
首末班车时间。油坊桥06:00 - 23:00 | 经天路06:00 - 23:00。
线路信息。新街口站可与1号线换乘，元通站可与10号线换乘。
3，南京地铁3号线。
首末班车时间： 林场06:00 - 23:00 | 秣周东路6:00 - 23:00。
线路信息：开工时间：2010年12月1日； 开通时间：2015年4月1日。
4，南京地铁4号线。
首末班车时间： 仙林湖06:00 - 23:00 | 龙江06:00 - 23:00。
线路信息：南京地铁4号线一期途径鼓楼区、玄武区、江宁区和栖霞区，线路西起龙江站，由南京主城一路向东。
5，南京地铁10号线。
首末班车时间： 安德门06:00 - 23:40 | 雨山路6:00 - 23:00。
线路信息：2014年7月1日已经开通。
6，南京地铁机场线(S1)。
首末班车时间： 南京南站6:00 - 22:00 | 禄口机场6:40 - 22:00。
线路信息：开工时间：2011年底； 开通时间：2014年。
7，南京地铁宁天城际(S8)。
首末班车时间： 泰山新村06:00 - 21:00 | 金牛湖06:00 - 21:00。
线路信息：本线路与其他线路暂无换乘。
8，南京地铁S1号线(机场线)。
首末班车时间： 南京南站06:00 - 22:40 | 空港新城江宁05:57 - 22:40。
线路信息：开工时间：2011年底； 开通时间：2014年。
9，南京地铁S3号线(宁和城际)。
首末班车时间： 高家冲06:00 - 22:00 | 南京南站06:00 - 23:00。
线路信息：南京地铁宁和S3号线开通，全长36.22公里，共有19座车站，其中将设置7个换乘站。
10，南京地铁S7号线(宁溧城际)。
首末班车时间： 空港新城江宁06:00 - 22:00 | 无想山06:00 - 22:00。
11，南京地铁S8号线(宁天城际)。
首末班车时间： 泰山新村06:00 - 22:00 | 金牛湖06:00 - 22:00。
线路信息：本线路与其他线路暂无换乘。
12，南京地铁S9号线(宁高城际)。
首末班车时间： 翔宇路南06:00 - 22:00 | 高淳06:00 - 22:00。
线路信息：南京地铁S9号线（又称宁高线）是南京地铁第九条建成运营的线路，也是南京地铁线网中一条南北走向的线路。
在林场站乘坐地铁3号线，21站后在南京南站下车；
3号出口出站，步行260米到达南京南站。
地铁全程需要51分钟左右，林场站的首班车是5点50分发车的，最早到达南京南站大约有6点41分左右。
南京3号线地铁时间表如下：林场 5:50 23:00 —— ——
星火路 5:53 23:03 6:21 0:19
东大成贤学院 5:55 23:05 6:19 0:17
泰冯路 5:58 23:08 6:16 0:15
天润城 6:00 23:10 6:14 0:12
柳洲东路 6:03 23:13 6:11 00:09
上元门 6:07 23:17 6:07 00:05
五塘广场 6:09 23:17 6:05 00:03
小市 6:12 23:22 6:02 00:00
南京站 6:00 23:24 6:00 23:58
南京林业大学·新庄 6:03 23:27 6:07 23:55
鸡鸣寺 6:06 23:31 6:04 23:51
浮桥 6:08 23:33 6:01 23:49
大行宫 6:00 23:35 6:00 23:47
常府街 6:02 23:37 6:15 23:44
夫子庙 6:04 23:39 6:13 23:42
武定门 6:06 23:42 6:10 23:40
雨花门 6:08 23:44 6:08 23:38
卡子门 6:10 23:46 6:06 23:36
大明路 6:00 23:48 6:04 23:34
明发广场 6:02 23:50 6:02 23:31
南京南站 6:04 23:53 6:00 23:29
宏运大道 6:06 23:55 5:57 23:27
胜太西路 6:09 23:58 5:54 23:24
天元西路 6:12 0:01 5:51 23:21
九龙湖 6:15 0:04 5:48 23:18
诚信大道 6:18 0:07 5:45 23:15
东大九龙湖校区 6:20 0:09 5:43 23:13
秣周东路 —— —— 5:40 23:10
