南通火车站是南通市的主要铁路客运站，连接宁启铁路和新长铁路，有火车通达6个铁路局（成都、济南、北京、武汉、太原、上海）管辖的城市。
历史：2003年旧站办理货运，2004年7月1日开办客运，2007年4月18日新站启用，2016年5月15日，宁启铁路正式开通动车组列车，南通步入动车时代。
例如：
车次:D3152
发站:南通(10:30)
到站:汉口(16:40)
历时:06:10
二等:260.5
一等:352
车次:D5454
发站:南通(06:25)
到站:南京(08:47)
历时:02:22
二等:105.5
一等:166
车次:D5458
发站:南通(07:37)
到站:如皋(08:01)
历时:00:24
二等:17
一等:27
车次:D3152
发站:南通(10:30)
到站:扬州(12:06)
历时:01:36
二等:68
一等:108
数据更新至2016年04月09日。
1K772 快速南通济南07:0118:47----07:01南通--2T7787 特快兰溪南通07:1021:0821:0821:08南通13小时58分当日到达3K771 快速济南南通07:3020:1020:1020:10南通12小时40分当日到达4K8503 快速南京南通07:5712:0712:0712:07南通4小时10分当日到达5T7788 特快南通兰溪08:0821:22----08:08南通--6K8505 快速淮安南通08:1212:3112:3112:31南通4小时19分当日到达7K8456 快速南通南京09:0013:03----09:00南通--8K8599 快速徐州南通09:2019:3819:3819:38南通10小时18分当日到达9K8467 快速南京南通09:2313:4113:4113:41南通4小时18分当日到达10K8600 快速南通徐州11:5822:27----11:58南通--11K564 快速南通太原13:0008:11----13:00南通--12K8455 快速南京南通13:5418:1618:1618:16南通4小时22分当日到达13K8506 快速南通淮安14:1018:13----14:10南通--14K8504 快速南通南京15:2319:13----15:23南通--15K384 快速南通汉口16:4508:23----16:45南通--16K722 快速南通昆明17:0009:40----17:00南通--17T236 特快南通重庆北17:1921:40----17:19南通--18Z140 直特南通北京17:5907:57----17:59南通--19K8468 快速南通南京18:0621:53----18:06南通--20Z52 直特南通北京18:3407:22----18:34南通-- 1.增开旅客列车
南通到汉口D3152/3 D3151/4 次动车组列车一对，经宁启沪蓉运行，由上海客运段、上海动车段担当。
汉口到南通D3158/5 D3156/7 次动车组列车一对，经沪蓉宁启线运行，由武汉局担当。
重庆北到南通 D2276/7 D2268/9 次动车组列车，经过经沪蓉宁启线运行，由武汉局担当。
南京～南通D5502/3 D5504/1次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5506/7 D5508/5次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5512/3 D5514/1次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5516/7 D5518/5次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5522/3 D5524/1次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5526/7 D5528/5次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5532/3 D5534/1次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5536/7 D5538/5次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5542/3 D5544/1次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
南京～南通D5546/7 D5548/5次动车组列车1对，经京沪、宁启线运行，由南京客运段、上海动车段担当。
2.停运管内旅客列车
南京～南通K8454/5 K8456/3次1对。
南京～南通K8502/3 K8504/1次1对。
南京～南通K8466/7 K8468/5次1对。
淮安～南通K8505/K8506次1对。
3.变更管内旅客列车运行区段
兰溪～南通T7786/7 T7788/5次1对，运行区段改为兰溪～杭州，经金千、沪昆线运行，车次改为T7786/T7785次，同时改由杭州客运段、上海车辆段担当。
