有影响。
根据国家中长期铁路规划（2016－2030年），中国将建设八纵八横高铁通道，其中就有京港（台）通道。其走向是：北京-衡水-菏泽-商丘-阜阳-合肥（黄冈）-九江-南昌-赣州-深圳-香港（九龙）高速铁路。该线路就是京九高铁。
京九高铁由北京至衡水客专（规划雄安支线）、衡水至商丘段（其中聊荷段河南省推荐过濮阳方案）、商合杭高铁（商丘-阜阳）、阜阳至九江段（安徽推荐东线合安九线路和湖北推荐西线阜冈九线路）、昌九高铁（九江-南昌）、昌吉赣高铁（南昌-赣州）、赣深高铁（赣州-深圳）以及广深港高铁（深圳-香港九龙）等新建线路和既有线路接驳而成，途经北京、廊坊、衡水、邢台、聊城、濮阳、济宁、菏泽、商丘、亳州、阜阳、潢川、黄冈、九江、南昌、吉安、赣州、河源、惠州、东莞、深圳、香港等地。
由于国家层面的规划未对京九高铁作出详细说明，京九高铁阜阳到九江段曾一度有两种不同声音：安徽主导的经商合杭与合安九高铁的“东线方案”；河南和湖北提出的阜阳经潢川、麻城至九江的阜潢九铁路客运专线“西线方案”。在河南和湖北方面看来，如果选择了合安九高铁（东线方案），则京九高铁将和大别山老区、鄂东地区失之交臂。
