克山县位于松嫩平原北部，地处小兴安岭南麓与松嫩平原的过渡地带，北部、中部为丘陵漫岗区，地形起伏变化大，南部是冲积平原，地势平坦。全县地势东北高西南低，分为低山丘陵、丘陵边缘岗地、漫岗平原、冲积平原、河滩地等地貌类型，丘陵漫岗地占80%，平原区占14%，洼地占6%，境内平均海拔高程236.9米，最高点381.7米，最低点198.7米。 克山县境内，有讷谟尔河、乌裕尔河、润津河等5条主要河流及爱民湖、为民湖、青年水库等6个水库。
据2014年1月23日，黑龙江省水文地质工程地质勘察院资料，2015年1月，该院勘测人员在地处克洛火山喷发带的黑龙江省克山县境内发现大型深层火山矿泉，经检测，矿泉水储量约为70亿立方米。
1915年(民国4年)3月，经黑龙江巡按公署呈请。设立讷东设治局，隶属黑龙江省龙江道。将讷河县东境、南境原警察区域第4、11、12区划为讷东设治局辖境，委任薛翘如为设治员。衙署初设二克山(今克东县城)，因治所附近有双山并峙，俗称克尔克图山(喀尔喀勒图山)，简称二克山。因山命名，遂于3月21日改称克山设治局，8月2日 改设克山县。9月，县衙迁移“三站”(亦称察霍镇，今克山县城)。
