系统如何控制仓储物流和物流？仓储的功能模块包括货物进出、库存、配送，这也是传统仓储物流的功能模块。货物的进出与仓库中货物的管理和控制紧密结合，构成了现代仓储物流的功能模块。
为了保证生产经营活动的正常开展，MES系统需要对仓储物流货物的收货、发货、平衡等活动进行有效控制，按类别记录各类货物的具体活动，以清晰、准确的方式表达仓储物流货物在数量和质量上的具体情况，以及该阶段货物的详细位置、部门、订单信息和仓储物流的分散程度。
与MES ERP系统相比，仓储管理的管控水平是有区别的。一般ERP系统可以控制仓库各类商品的总量以及所有商品进出的具体情况。而ERP系统未能控制货物在仓库中是如何存储的，也未能有效控制货物进出的规则，如:先进先出控制、零零碎碎的先出控制等。
MES系统正好弥补了ERP系统在这些方面的不足。它从货物进厂的检验开始，跟踪货物的进出，生产线的应用成本，生产线的剩余返回到仓库，产品质量问题返回到生产线的供应商。为商品建立完善的历史信息个人档案，并给出相应的查找和管理方案，满足客户对商品的统计分析和追溯要求。
有了MES ERP系统，在实际操作中，要用相互集成的方法进行信息沟通，从根本上保证仓储物流信息的正确性和及时性，提高工厂对商品的管理能力。在MES系统中，所有的关键物品都是通过条形码进行控制，并根据实际操作情况，实时汇总，然后传输到ERP系统中，这样双方就可以了解到现阶段仓库中货物库存的具体情况，线上堆积的具体情况，线上消耗的具体情况等信息。
此外，MES系统根据一段时间的生产排产计划生成货物的需求清单，并对比货物的具体库存情况，将货物的缺货信息上报给ERP系统，以便ERP系统快速响应，产生制成品的采购清单，保证生产制造的顺利进行。
MES系统中的商品统计信息最接近生产制造实际，最及时准确。根据不同行业对仓库管理的不同要求，MES系统可以将货物的相关信息共享给我公司的物流管理系统和其不同层级的外部供应商的物流管理系统，使各分工协作部门清楚地知道生产线如何安排生产制造，未来对货物的需求，具体的交货时间和地点等等。
